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dMCMC:马尔可夫链蒙特卡罗诊断。

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简介:
MCMC 马尔可夫链蒙特卡罗诊断 (dMCMC) 是一种强大的工具,它提供了一系列函数,用于快速地生成多面板图,从而对 MCMC 输出进行全面评估,并能够便捷地将 MCMC 链数据(由 rjags 返回)转化为易于使用的 LaTeX 表格。 这些函数的核心是 R 领域的优秀包 xtable 和 coda。 然而,dMCMC 的主要设计理念在于将最关键的信息有效地汇总成直观且引人注目的图表,或者为您快速地完成表格的格式化工作。 对于那些每天需要处理大量不同贝叶斯模型的情况来说,dMCMC 应该会证明其价值。 dMCMC 在组合模型中引入一项重要的创新:先验与后验图的可视化呈现。 在某些情况下,避免对先验选择进行细致的审查可能至关重要,因此这种先验与后验图的结合提供了极大的便利。 目前,该工具尚未正式发布,但未来可能会推出。 您可以通过下载相关文件并解压缩后运行 `R CMD INSTALL` 来尝试使用它,或者借助 devtools 包安装开发版本。 同时建议您更新当前 R 包的最新版本:`update.packages`。

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客服
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  • dMCMC
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    dMCMC是一种先进的统计分析工具,用于评估马尔可夫链蒙特卡罗方法的有效性。它能够帮助研究人员准确地诊断和优化复杂的模型模拟过程。 MCMC 马尔可夫链蒙特卡罗诊断 (dMCMC) 提供了一组用于创建多面板图的函数,以快速评估 MCMC 输出,并轻松将由 rjags 返回的 MCMC 链表转换为方便使用的表格。这些功能基于优秀的 R 包 xtable 和 coda 实现。 尽管如此,dMCMC 的主要目标是汇总最有用的信息到一个有吸引力的图表中或快速格式化表格。对于每天使用多种不同贝叶斯模型的人来说,这应该非常有用。一项 dMCMC 创新功能包括先验与后验图,这对于不想仔细检查先验选择的用户来说可能是至关重要的考虑因素。 目前没有发布版本,但可能有一天会发布正式版。你可以下载相关文件并解压运行 R CMD INSTALL 来安装它,或者使用 devtools 包来安装开发版。请确保你的当前包是最新的。
  • (MCMC)方法
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    马尔科夫链蒙特卡罗(MCMC)是一种统计学中用于从概率分布中抽取样本的技术,广泛应用于贝叶斯数据分析与机器学习领域。 详细介绍了马尔科夫蒙特卡罗(MCMC)的各种算法,并包括了吉布斯抽样法的实例以及基本源代码,内容易于理解,非常值得一看。
  • 详解MCMC(算法)的真正含义?
    优质
    本文深入解析MCMC算法的核心概念与工作原理,帮助读者理解其在概率统计和机器学习中的应用价值。 MCMC方法用于在概率空间内通过随机采样来估算感兴趣参数的后验分布。蒙特卡罗方法可以进行采样,马尔科夫链同样也可以独立完成采样的任务,那么为什么要把两者结合起来呢?这样做有什么优势?
  • MCMC matlab教程_MCMC__洛方法_模型_matlab
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    本教程详细介绍如何使用MATLAB进行MCMC(马尔科夫链蒙特卡洛)模拟,涵盖马尔可夫模型及蒙特卡洛方法的应用与实践。 MCMC马尔可夫链蒙特卡洛法入门教程,内含代码示例。
  • 洛方法(MCMC)
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    马尔科夫链蒙特卡洛(MCMC)是一种结合了马尔科夫链与蒙特卡罗方法的概率统计技术,用于高效地从复杂的概率分布中进行采样。 我打算从头开始在Python中实现Metropolis-Hastings算法来查找虚拟数据示例的参数分布,并将其应用于现实世界的问题。我会仅使用numpy库来编写该算法,并利用matplotlib展示结果。如果需要,我可以借助Scipy计算密度函数,但同时也会演示如何通过numpy实现这些功能。此外,我已经将MH-Gibbs添加到了我的代码仓库中。
  • 洛技术.pdf
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    本文档深入探讨了马尔科夫链蒙特卡洛(MCMC)方法,一种用于从复杂概率分布中抽样的统计技术。通过详细讲解其理论基础与应用实例,为读者提供了全面的理解和实用指南。 马尔科夫链蒙特卡洛(MCMC)方法是一种在统计学与计算概率领域广泛应用的数值模拟技术,在处理复杂的贝叶斯推断问题上尤为关键。该方法利用了马尔科夫链的特点,通过构建一个随机过程来生成样本,这些样本能够代表目标分布。这种方法特别适用于高维空间中的积分问题解决以及后验概率分布的计算。 在贝叶斯统计中,我们使用先验分布π(θ)和观测数据x的似然函数fx|θ(x),结合它们得到未知参数θ的后验分布fθ|x(θ|x)。这可以通过贝叶斯公式表达为: \[ f_{\theta|x}(\theta|x) = \frac{f_{x|\theta}(x)\pi(\theta)}{f_x(x)} \] 实践中,我们通常需要求解关于后验分布的期望值E[g(θ)|x],这涉及到对后验分布进行积分: \[ E[g(\theta)|x] = \int g(\theta)f_{\theta|x}(\theta|x)d\theta / \int f_{\theta|x}(\theta|x)d\theta \] 对于高维的参数空间,这种积分变得极其复杂,传统数值方法(如矩法、泰勒级数等)往往无法有效解决。 MCMC通过构造一个马尔科夫链来实现目标分布π(θ)作为平稳分布。这意味着我们可以通过长时间模拟这个过程获得接近于目标分布的样本集。 其中的核心是马尔科夫-哈斯汀斯(Metropolis-Hastings)算法,它允许非对称转移概率的存在,并生成从一个状态到另一个状态的采样序列。该算法包括以下步骤: 1. 提出一个新的状态θ。 2. 计算接受率α = min(1, fθ|x(θ)fθ|x(θ))。 3. 以概率α接受新状态,否则保持原状态不变。 除此之外还有其他MCMC采样器如Metropolis采样器、随机游走Metropolis以及独立采样器等。对于多参数情况下的单分量马尔科夫-哈斯汀斯算法,则通过一次仅更新一个参数来提高效率。 在实际应用中,例如逻辑回归模型的贝叶斯推断过程中,MCMC方法可以用来估计参数的后验分布,并提供关于这些参数不确定性的信息。因此,尽管可能需要较长计算时间,但其灵活性和准确性使得它成为现代统计分析中的重要工具之一。
  • 洛方法
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    马尔科夫链的蒙特卡洛方法(MCMC)是一种统计学中用于从概率分布中抽取随机样本的技术,特别适用于高维空间中的复杂模型。 马尔科夫链蒙特卡洛(MCMC)是一种基于概率论的计算方法,主要用于对高维积分和最优化问题进行随机抽样。该算法的核心思想是构建一个平稳分布正好为目标分布的马尔科夫链,并通过模拟这条路径来进行采样。这种方法能够在不知道概率分布函数或其反函数的情况下,从复杂或高维度的概率分布中抽取样本以近似计算积分值及期望。 MCMC方法在贝叶斯统计和推断中有广泛的应用,因为它能够用来计算后验概率以及边际分布。在进行贝叶斯推理时,常见的问题是标准化常数的确定与边缘化过程中的变量处理。其中,标准化常数是指比例因子以确保所有可能性加起来为1;而边缘化则是指根据已知条件推导未知部分的概率分布。 此外,MCMC还被应用于统计力学中,用于总结力学系统的平均行为表现。其基本原理是利用蒙特卡洛模拟——即通过大量随机抽样来近似积分和期望值,在某些情况下目标概率难以直接抽取时,则用一个较易采样的提议分布作为过渡工具,并结合接受-拒绝法及重要性抽样等技术手段实现。 MCMC的重要应用场景包括机器学习、物理科学、统计分析以及计量经济等领域。它在这些领域中主要解决的问题有:贝叶斯推断与模型选择,力学系统平均行为的计算,带有惩罚项的似然函数优化问题中的目标值最小化或最大化等。 金融行业也广泛利用MCMC技术进行期权定价和风险评估分析。例如,在股票价格模拟过程中可以用来估算期权价值;或者在考虑多种因素的情况下预测潜在的风险水平。这类情形下,由于难以通过解析方法直接求解复杂模型,因此MCMC成为解决此类问题的有效工具。 尽管MCMC具有强大的功能,但其也存在一定的局限性:例如,在应用接受-拒绝抽样技术时如果上限值设定过高会导致采样效率降低;而在重要性抽样的过程中选择恰当的参考分布同样是个挑战。因为不合理的选取会显著影响到算法的效果和准确性。 总的来说,作为一种高效的随机抽样方法,MCMC为解决复杂概率问题提供了有力手段,在理论研究及实际应用中都占据了非常重要的地位,并且随着计算资源的增长与技术的进步,其在未来科学研究和技术开发中的作用将更加突出。
  • MCMC入门学习资料:初学者指南
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    本资料为MCMC初学者提供全面指导,涵盖马尔可夫链与蒙特卡罗方法的基本概念、原理及应用实例。适合数据分析和统计学爱好者参考学习。 马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)入门学习资料包括Metropolis Sampling、Metropolis-Hastings Sampling以及Gibbs Sampling的相关内容及对应程序。这些材料选自2011年Mark Steyvers的《使用Matlab进行计算统计》课程中的MCMC部分。
  • 基于差分进化的加速的MATLAB代码下载
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    本资源提供一种结合差分进化与马尔可夫链蒙特卡罗方法的算法优化方案,并附带实现该算法的MATLAB源码,旨在提高参数估计效率。 下面提供的代码实现了马尔可夫链蒙特卡罗算法,并通过并行运行多个链来提高后验探索的效率。该算法名为DREAM_(ZS),它是基于原始DREAM采样方案的一种改进,利用来自过去状态存档中的样本生成每个单独链条内的候选点。Vrugt等人在2009年提出了这一理论及其数值示例,并且Ter Braak和Vrugt (2008)也提供了相关的信息。 使用过去的抽样有三个主要优点:(1) 它避免了需要N = d的后验条件,这会加速高维问题(大d)收敛到一个限制分布。(2) 异常链不需要特别处理。通过对历史状态进行采样,在模拟过程中任何时刻异常轨迹都可以直接跳转至模态区域。(3) 每个链条中转换内核定义的每次跳跃都不需要当前状态的信息,这在多处理器环境中具有显著优势,因为可以同时生成N个候选点,并且每个链可以在不同的计算机上最有效地进化。关于这一方面的更多细节将在未来的出版物中给出。 有关此代码的更多信息和使用方法,请查阅下载文件中的README.md文档。