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GEO平台注释表读取工具:使用Matlab从GEO读取和解析*.annot文件

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简介:
本工具有助于科研人员利用Matlab高效地从GEO数据库中读取和解析*.annot文件,支持数据的快速提取与分析,简化生物信息学研究流程。 该函数用于读取并解析NCBI Gene Expression Omnibus(GEO)的平台注释表(*.annot)。平台注释表包含有关特定平台的信息。 输入: - 文件名:*.annot 输出: - 平台注解信息 - 平台表 例子: 1) 获取一个名为GPL2883.annot 的文件,例如可以从ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/platforms/GPL2nnn/GPL2883/annot/GPL2883.annot.gz下载,并将其解压为GPL2883.annot。 2) 将函数和 annot 文件放在你的工作目录中,或者使用 addpath 命令将路径添加到搜索路径中。 3)运行函数[注释, 平台表] = read_annot_file(GPL2883.annot);

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客服
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  • GEO使MatlabGEO*.annot
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