
GEO平台注释表读取工具:使用Matlab从GEO读取和解析*.annot文件
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简介:
本工具有助于科研人员利用Matlab高效地从GEO数据库中读取和解析*.annot文件,支持数据的快速提取与分析,简化生物信息学研究流程。
该函数用于读取并解析NCBI Gene Expression Omnibus(GEO)的平台注释表(*.annot)。平台注释表包含有关特定平台的信息。
输入:
- 文件名:*.annot
输出:
- 平台注解信息
- 平台表
例子:
1) 获取一个名为GPL2883.annot 的文件,例如可以从ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/platforms/GPL2nnn/GPL2883/annot/GPL2883.annot.gz下载,并将其解压为GPL2883.annot。
2) 将函数和 annot 文件放在你的工作目录中,或者使用 addpath 命令将路径添加到搜索路径中。
3)运行函数[注释, 平台表] = read_annot_file(GPL2883.annot);
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