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Matlab代码sqrt-NiiStat: 用于临床人群神经影像数据分析的Matlab脚本集合

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简介:
这段简介可以这样描述: Sqrt-NiiStat是为临床人群的神经影像数据提供分析功能的MATLAB脚本集,专为科研人员及医生设计,助力高效精准的数据处理和统计分析。 NiiStat是一组用于分析临床人群神经影像数据的Matlab脚本。该GitHub存档包含最新版本。有关用法,请参见2016年10月9日更新:保存节点/边缘图以进行连接组分析(DTI/Rest,GLM/SVM)。直接支持大多数NPMval文件,并使用统一逻辑掩码代码。 在2016年6月30日的版本中,主程序名称从“nii_stat”更改为“NiiStat”,与NITRC行为数据匹配。此更新修复了特定于该日期版本的问题,在绘制感兴趣区域地图时出现问题。脚本会自动检查是否有可用的GitHub更新。 2015年3月3日增加了ALF和fMRI模式,而2014年8月29日修正了一个错误:当进行相关分析且需要删除白质区域但未包括任何白质区域ROI的情况下程序将崩溃。同年9月3日引入了dtifc模式用于扩散束成像中的纤维计数(而非密度)。 此外,到2014年9月8日为止的版本已经修复了一些问题,并提供了新的功能和改进。

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  • Matlabsqrt-NiiStat: Matlab
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    这段简介可以这样描述: Sqrt-NiiStat是为临床人群的神经影像数据提供分析功能的MATLAB脚本集,专为科研人员及医生设计,助力高效精准的数据处理和统计分析。 NiiStat是一组用于分析临床人群神经影像数据的Matlab脚本。该GitHub存档包含最新版本。有关用法,请参见2016年10月9日更新:保存节点/边缘图以进行连接组分析(DTI/Rest,GLM/SVM)。直接支持大多数NPMval文件,并使用统一逻辑掩码代码。 在2016年6月30日的版本中,主程序名称从“nii_stat”更改为“NiiStat”,与NITRC行为数据匹配。此更新修复了特定于该日期版本的问题,在绘制感兴趣区域地图时出现问题。脚本会自动检查是否有可用的GitHub更新。 2015年3月3日增加了ALF和fMRI模式,而2014年8月29日修正了一个错误:当进行相关分析且需要删除白质区域但未包括任何白质区域ROI的情况下程序将崩溃。同年9月3日引入了dtifc模式用于扩散束成像中的纤维计数(而非密度)。 此外,到2014年9月8日为止的版本已经修复了一些问题,并提供了新的功能和改进。
  • MATLAB EEGLAB实验对比:EEG
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    这段简介可以这样编写: 本项目汇集了针对EEG数据处理的MATLAB与EEGLAB平台下的实验代码,旨在为科研工作者提供一套便捷的数据分析脚本集。 MATLAB是一种广泛应用于科学计算、图像处理及数据分析的高级编程环境;EEGLAB则是运行于MATLAB上的强大工具,专门用于脑电图(EEG)数据的处理与分析。本压缩包中的matlab对比实验代码-EEGLAB_scripts提供了一系列脚本,旨在帮助用户在MATLAB中使用EEGLAB进行有效且高效的EEG数据分析。 作为一款开源系统,EEGLAB允许其源码公开访问,因此使用者可以根据个人需求对其进行修改和扩展。这不仅促进了研究者与开发者之间的沟通交流,也使得社区能够贡献新的算法及功能。 处理EEG数据通常涉及以下步骤: 1. 数据导入:脚本支持多种格式的文件读取(如EDF、BDF等),并可以执行初步的数据预处理工作。 2. 信号质量评估:通过视觉检查和统计方法,帮助识别不良通道,并标记出由接触问题或肌肉活动引起的异常数据点。 3. 重新参考化:脚本包含多种重参考技术的应用(如平均参考、耳电极链接等),以减少头皮电位的影响。 4. 时频分析:EEGLAB支持傅里叶变换和小波变换,用于将信号从时间域转换到频率域,并进行相应的频谱特征分析。 5. 节段切割:根据实验设计自动分割EEG数据(如基于事件相关电位的触发器)。 6. 噪声去除:利用独立成分分析等技术识别并移除眼动、肌肉以及其他非脑源性噪声。 7. 空间滤波:应用空间滤波方法,例如最小方差法或主成分分析以减少噪音并增强信号强度。 8. 脑源定位:采用皮层体模解剖定位等技术估算引起EEG变化的大脑区域位置。 9. 统计分析:脚本可能包含t检验、ANOVA及非参数测试,用于比较不同条件或群体之间的差异性。 10. 结果可视化:通过时间序列图、功率谱密度图和地形图等多种图形展示处理结果。 该压缩包中的EEGLAB_scripts-master很可能包含了上述步骤的MATLAB脚本。对于从事EEG研究的研究人员而言,理解和使用这些脚本能显著提高工作效率,并有助于发现有价值的实验对比结论。
  • MATLABsqrt-Polarizemic:三量地震极化
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  • 试验结果预测:基试验
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    本研究聚焦于通过先进的统计与机器学习方法,对临床试验数据进行深度挖掘和模式识别,以实现对未来临床试验结果的精准预测。致力于提升药物研发效率及成功率。 临床试验结果预测 1. 通过Conda安装 使用conda.yml文件创建并激活环境: ``` conda env create -f conda.yml conda activate predict_drug_clinical_trial ``` 2. 原始数据 原始数据存储在`.ClinicalTrialGov`目录中,包含超过348,891条临床试验记录。由于不断新增的临床试验信息,数据量会持续增长。 3. 数据预处理 3.1 收集所有NCTID 从`.ClinicalTrialGov`目录下收集所有的XML文件,并将结果存放在`data/all_xml`中: ``` find ClinicalTrialGov -name NCT*.xml | sort > data/all_xml ``` 3.2 疾病分类到ICD-10编码 此步骤涉及将疾病名称映射为ICD-10编码,输入数据包括ClinicalTrialGov目录下的文件和`data`中的重写内容。
  • BP算法网络-MATLAB实现及+
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    本项目采用MATLAB平台,运用BP(反向传播)算法构建人工神经网络,并进行数据训练与分析。附带详细源代码供学习参考。 数据包含2000个样本,每个样本有25个因子。第一个因子表示该样本的种类,并分为1至4类;其余的24个因子则代表了这个样本的具体特征。在编写MATLAB程序时,请注意这些细节。
  • IMDb评文-基网络
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    本数据集包含IMDb电影评论及其情感标签,采用神经网络技术进行文本分类,旨在研究与开发先进的自然语言处理和机器学习模型。 ACLIMDB_v1 是一个大型电影评论数据集,由斯坦福大学提供。该数据集包含50,000条电影评论(其中一半为正面评价,另一半为负面评价)。这些评论被分为训练和验证两个部分,每个部分各有25,000条评论,并且正负比例相同。此外,还有5,000条未标注的影评。 另一个数据集是rt-polaritydata,这是一个较小的数据集,同样由IMDB整理而成。该数据集包含10,662条电影评论(正面和负面各占一半)。这些评论已经经过初步处理,包括分隔标点符号并转换为小写形式,并且每行是一则简短的电影评价。
  • 医学DICOM软件
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    临床医学影像DICOM软件是一款专为医疗行业设计的专业工具,支持DICOM标准格式,用于存储、传输及处理各类医学影像数据。 这款医疗看图软件支持放射、超声、内镜、病理及核医学图像的查看,文件类型为DICOM格式。它既可以在本地使用,也可以在局域网环境中运行,并且安装简便易用。
  • MATLAB网络预测
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    本研究运用MATLAB平台开发神经网络模型,专注于预测数据的分析与优化,探索其在复杂系统中的应用潜力。 使用神经网络进行预测时可以采用BF(Backpropagation)、FF(Feedforward)、GRNN(General Regression Neural Network)和RBF(Radial Basis Function)网络等多种方法。
  • Toolbox-Romano-et-al: 体钙成Matlab计算工具箱
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    简介:Toolbox-Romano-et-al是一款专为分析神经元群体钙成像数据设计的Matlab工具箱,提供一系列算法和函数用于处理和解析复杂的大规模神经活动记录。 有关教程和完整说明,请参阅 Romano 等人的预印本 A 计算工具箱和分步教程,用于分析钙成像数据中的神经元种群动态 (doi.org/10.1101/103879)。该工具箱在 Romano 等人 (doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005526) 的论文中演示了用于分析神经元种群动态的综合钙成像处理工具箱。此工具箱由斑马鱼神经行为学实验室开发。
  • MATLAB网络案例程序及
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    本书提供了使用MATLAB进行神经网络案例分析的详细程序和实用数据集,旨在帮助读者理解和应用先进的机器学习技术。 这个包包含了30个用MATLAB编写的神经网络案例的代码,所有代码都是可以运行的,并且还附带了用于试验的数据。