
matvec-mpi:通过 MPI 协同计算稀疏矩阵与向量的并行乘法。
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简介:
##稀疏矩阵向量乘法与 MPI 并行###设计
该设计采用 MPI 并行化稀疏矩阵向量乘法。首先,在第一步中,利用一维行分解读取文件,并将数据均匀地分发到所有处理器上。这一过程需要 O(n) 的时间复杂度,其中 n 代表矩阵的行数,nnz 则表示非零元素的数量。矩阵 A 的数据采用 CSR (Compressed Sparse Row) 格式进行读取和存储,该格式包含三个关键数组:行指针数组、非零列索引数组以及矩阵值数组。此外,第一步还利用 MPI Bcast 函数将数据分发到 p 个处理器。每个进程随后会调用 prepareRemoteVec 函数来获取其所需的非本地向量元素。具体而言,每个进程会遍历其本地列索引数组,并检查是否需要从其他处理器获取远程向量条目;若需要,则会调整本地向量数据数组(vSize + numRemoteVec)的大小,以便在数组的末尾存储来自其他处理器的这些额外远程向量条目。最后,为了保证数据的正确性,需要重新索引本地列索引数组(使其指向全局向量数据索引)。此操作包括遍历本地列索引数组,并更新其指针指向。
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