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癌症基因数据集合(PAAD、LUAD、KIRC、BRCA和BLCA)

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简介:
该数据库整合了多种癌症类型(包括胰腺癌、肺癌、肾癌、乳腺癌及膀胱癌)的基因组信息,为研究提供全面的数据支持。 五类癌症基因数据集包括PAAD、LUAD、KIRC、BRCA和BLCA,可用于进行癌症基因分类、基因关系分析与预测等工作。

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  • PAADLUADKIRCBRCABLCA
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    该数据库整合了多种癌症类型(包括胰腺癌、肺癌、肾癌、乳腺癌及膀胱癌)的基因组信息,为研究提供全面的数据支持。 五类癌症基因数据集包括PAAD、LUAD、KIRC、BRCA和BLCA,可用于进行癌症基因分类、基因关系分析与预测等工作。
  • 从KEGG库中获得通路的
    优质
    本研究从KEGG数据库提取并分析了多种癌症相关的信号传导和代谢路径中的关键基因集合,为理解癌症发病机制提供了重要数据支持。 如何利用在线数据库检索各种癌症相关Pathway的已知基因信息?
  • 患者
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    该数据集包含大量癌症患者的医疗信息,旨在为研究人员提供一个全面的数据资源库,以促进癌症研究和治疗的发展。 由于癌症的影响,许多人的寿命被缩短。然而,在大数据时代到来之际,我们有了与这种致命疾病斗争的希望。通过分析如《cancer patient data sets.xlsx》这样的数据集,研究人员能够发现新的治疗途径并改善患者的生活质量。
  • CT影像
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    该数据集包含多种癌症患者的CT影像资料及对应的临床信息,旨在支持医学研究和AI辅助诊断技术的发展。 本数据集包含69位不同患者的475个癌症CT影像病例以及患者年龄信息,是TCGA-LUAD肺癌CT影像数据库的一部分。
  • 的决策树分类实验分析
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    本研究运用决策树算法对癌症基因数据进行分类分析,旨在探索不同基因特征与癌症类型之间的关联性,并优化分类模型以提高预测准确率。 数据挖掘课程实验基于癌症基因数据集进行决策树分类研究,采用ID3算法和C4.5算法对五种癌症类型(BLCA、BRCA、KIRC、LUAD、PAAD)的基因数据进行分类分析。
  • 预测的cancer.csv
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    cancer.csv 数据集包含了用于癌症预测研究的相关医疗记录和生物标记信息,旨在帮助研究人员开发早期诊断模型。 癌症预测数据集包含用于训练机器学习模型的数据,这些模型旨在帮助医生更早地识别和诊断各种类型的癌症。该数据集中包含了患者的多项生理指标、生活习惯及过往病史等相关信息,可用于研究如何提高早期检测的准确性以及优化治疗方案。
  • 患者,包含100条记录
    优质
    本数据集收录了100名癌症患者的医疗信息,旨在为癌症研究与治疗提供参考依据。涵盖诊断、治疗及预后等多维度细节。 用于KNN算法的癌症数据存储为csv文件,包含以下字段:id、诊断结果(B表示健康,“M”表示患病)、半径、纹理、周长、面积、光滑度、紧实度、对称性以及分形维度。
  • TCGA-BRCA-mRNA表达( TPM ) - 乳腺表达与临床整理
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    本数据集基于TCGA-BRCA项目,包含乳腺癌患者的mRNA表达量(TPM值)及相应的临床信息,旨在支持相关研究。 TCGA-BRCA-mRNA表达数据(TPM)是研究乳腺癌基因表达的重要资源,提供了大量关于乳腺癌患者分子层面的信息。TPM(Transcripts Per Million)是一种标准化的度量方式,用于量化转录本丰度,并考虑了测序深度的影响,使得不同样本间的数据具有可比性。在这个数据集中,每条记录对应一个特定样本中的某个基因表达水平,这些数据通常用于探索基因表达与疾病状态之间的关系,包括癌症的发生、发展和预后。 在进行数据分析时,将TPM值转换为log2(TPM+1)是常见的处理步骤。这是因为原始的TPM值可能分布在很大的范围内,直接使用可能导致计算上的不稳定性,尤其是当TPM值接近零时。log2转换可以平滑数据分布,并避免了负值和对数零的问题。加1是为了处理TPM值为零的情况,因为对数值不能取0。 BRCA_clinicalMatrix文件可能包含了乳腺癌患者的临床信息,如年龄、性别、肿瘤分级、病理分期以及生存状态等。这些信息对于理解基因表达变化与临床特征之间的关联至关重要,并可以用来构建生存模型、寻找预后标志物或识别潜在的治疗靶点。 BRCA_TPM.csv文件则是主要的基因表达数据集,其中列代表不同的基因ID,行对应于各个样本。每个单元格内的数值表示该基因在相应样本中的TPM值。通过这个文件,研究人员可以分析乳腺癌患者中特定基因的表达模式,并找出差异表达的基因以进一步研究其在疾病发生和发展过程中的作用。 这些数据集可能被用于多种类型的分析方法,例如: 1. 差异表达基因分析:比较正常组织和肿瘤组织之间的基因表达情况,从而识别出显著上调或下调的关键基因。 2. 生存分析:结合临床信息来探究某些特定基因的表达水平与患者生存期的关系。 3. 路径富集分析:通过识别参与特殊生物通路或者功能模块中的关键基因,揭示乳腺癌背后的生物学机制。 4. 预后模型构建:运用机器学习或统计方法建立基于基因表达数据预测患者的预后的数学模型。 5. 互作网络分析:研究基因间的相互作用关系,并理解在复杂调控网络中乳腺癌的发展过程。 TCGA-BRCA-mRNA 表达数据集提供了深入探究乳腺癌分子机制的宝贵资源,有助于发现新的生物标志物和潜在治疗靶点。通过正确的数据分析处理(如log2转换)以及结合临床信息,在研究过程中可以揭示更多关于该疾病的未知领域。
  • 肾透明细胞mRNA表达与临床整理(于TCGA-KIRC
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    本研究收集并分析了TCGA数据库中肾透明细胞癌患者的mRNA表达和相关临床数据,旨在探索基因表达模式与临床特征之间的关联。 TCGA-KIRC数据集已整理成LCPM格式,并且临床数据也已完成汇总与整理。LCPM即log2(CPM+1)格式,在当前分析中被认为比log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)更为先进,部分生信文章的审稿人推荐使用此格式进行数据分析。