bai-indexer：帮助您构建 BAM 索引（BAI）

简介：
Bai-indexer是一款用于生物信息学的工具，专门设计来快速高效地为BAM格式文件生成索引(BAI)，便于后续的大规模数据处理和分析。 BAM（Binary Alignment/Map）是一种常见的文件格式，用于存储来自基因测序机的对齐读数。由于这些文件可能会变得非常大（超过100GB），因此拥有一个支持快速查找的索引会很有帮助。 为了生成这种索引，SAMTools提供了一个简单的命令： ``` samtools index file.bam file.bam.bai ``` 然而，BAM索引（BAI）文件也会变得很大，通常达到10MB或更多。当使用如基因组浏览器这类工具时，通过慢速网络加载大型 BAI 文件是显示对齐轨迹不可避免的第一步。 bai-indexer 旨在解决这个问题，它会建立你的 BAM 索引的索引——这是一个小的 JSON 文件，将参考 ID（例如染色体编号）映射到BAI文件中的字节范围。通过这种方法，查看器只需加载实际需要的那一部分BAM索引即可。