
GFP阳性细胞检测
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简介:
简介:GFP阳性细胞检测是一种利用绿色荧光蛋白标记技术来识别和分析特定基因表达或蛋白质定位的研究方法。该技术广泛应用于生物学、医学及遗传学研究中。
运行脚本“sh run_script.sh $brainID”以获取结果。
本段落的代码库如下:
Sukhendu Das, Jaikishan Jayakumar, Samik Banerjee, Janani Ramaswamy, Venu Vangala, Keerthi Ram 和 Partha Mitra。
BioRxiv(2019):252247。
构型
将输入的Brain图像以JP2格式存储,并在文件名中包含字母F,代表荧光部分,同时包括对应的BrainID。
如果您有“脑区域分割”(如.mat文件),请将其存储在$brainID/reg_high_seg_pad 文件夹内;
如果有其他格式的“脑区域分割”,则需正确读取该分割数据并确保其能表示为GFP_Cell_Detection main_bam.m 第28行中的单通道图像。
如果没有“脑区域分割”信息,请注释掉相关部分。
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