
SIS数学模型MATLAB代码-Stochastic-SIS:采用Gillespie算法进行SIS传染病仿真的Matlab程序
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简介:
本项目提供基于Gillespie算法模拟SIS(易感-感染)传染病传播过程的MATLAB代码,适用于研究随机环境下疾病扩散的动力学行为。
这些文件是为蒙特克莱尔州立大学数学科学系Eric Forgoston博士指导下的学术研究而创建的。该研究旨在探索“预警信号”的理论及其在具有Allee效应的流行病学和人口模型中的应用,以便研究影响这些动态系统行为的控制机制。存储库中找到的代码(包括MATLAB和FORTRAN版本)遵循SIS(易感-感染-易感)流行病模型。模拟是通过采用Gillespie算法来完成随机流行病数据的生成。
文件Gillespie_SIS_V3是主要的模拟文件,它绘制了模拟结果,并允许用户在特定时间点对总体进行“脉冲”。而Gillespie_SIS_V6与V3相似,但仅用于产生预定数量的时间序列。Gillespie_SIS_V7同样类似于V3版本,但在自相关值达到统计阈值时会自动触发脉冲操作;这是通过读取包含这些预设值的.csv文件来实现的。
此外,“Gillespie_SIS_V5”是Gillespie_SIS_V3在FORTRAN语言中的版本,并且没有实施任何控制措施。
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