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基于Transformer的Unet编码器实现

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简介:
本研究提出了一种基于Transformer架构的改进型U-Net编码器,旨在提高医学图像分割任务中的性能和效率。 变压器-Unet 是一种使用变压器编码器的 Unet 实现。

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  • TransformerUnet
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    本研究提出了一种基于Transformer架构的改进型U-Net编码器,旨在提高医学图像分割任务中的性能和效率。 变压器-Unet 是一种使用变压器编码器的 Unet 实现。
  • UNet判别StyleGAN2 PyTorchUNet-StyleGAN2
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    本项目为基于PyTorch框架下的UNet-StyleGAN2实现,采用改进型的UNet结构作为判别器,旨在提升图像生成的质量与多样性。 使用UNet Discriminator实现Stylegan2。该存储库的工作方式与原始的StyleGAN2相似。只需将所有stylegan2_pytorch命令替换为相应的unet_stylegan2命令。 更新:结果非常好,接下来需要研究如何将其与其他一些技术结合,并编写完整的使用说明。 安装: ```shell $ pip install unet-stylegan2 ``` 用法: ```shell $ unet_stylegan2 --data .pathtodata ``` 引文: @misc { karras2019analyzing , title = { Analyzing and Improving the Image Quality of StyleGAN } , author = { Tero Karras and Samuli Laine and Miika },
  • EfficientUnet-PyTorch: EfficientNetUnet在PyTorch 1.0中-源
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    EfficientUnet-PyTorch是一个基于EfficientNet作为编码器、集成至U-Net架构的深度学习项目,专为医学图像分割设计,并采用PyTorch 1.0框架开发。此代码库旨在提供高效且准确的语义分割解决方案。 高效的Unet-PyTorch 以EfficientNet为编码器的Unet在PyTorch 1.0中的实现需要注意解码器路径中存在的舍入问题(这不是错误)。因此,输入形状应能被32整除。例如,适合的输入图像尺寸是224x224,但不适合的是225x225。 安装和使用: - 安装efficientunet-pytorch:`pip install efficientunet-pytorch` 用法示例1.高效网 如果您想要一个预训练的efficiencynet-b5模型,并且该模型有五个类别,您可以这样做: ```python from efficientunet import * model = EfficientNet.from_name(efficientnet-b5, n_classes=5, pretrained=True) ``` 请确保Python版本大于等于3.6和PyTorch版本大于等于1.0.0。
  • Keras-TransformerKeras变压
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    Keras-Transformer是一款利用Keras框架构建的高效Transformer模型实现工具,适用于自然语言处理任务,提供简洁、灵活的API接口。 我们实施了一个名为“注意就是您所需要的”的变压器项目,并提供了详细的指南来帮助理解变压器的概念以及所需的Keras功能和技术(请参阅Guide.md和Walkthrough.md)。我们的目标是让社区能够以更稳健且更快的方式创建并自动化定制的Keras层、模型及解决方案。此外,我们还分享了通过DSL设置机器翻译演示的例子。 如果有条件训练大型模型,并愿意共享结果,我们将非常感激。由于计算资源有限,目前无法进行全面测试;不过,在开发过程中已进行了正式和非正式的测试。我们也欢迎任何建议或需求反馈。如果您有其他Keras技巧或者替代方法,请为文档贡献您的知识。关键在于通过DSL定义模型训练及解码过程从而实现自动化执行,并从定制培训师中抽象出基本的培训信息(如检查点、工件管理等)。同时,我们还保留了生成器明确接口以支持所谓的“内生生成器”。
  • TensorFlowUNet:UNet_with_TensorFlow
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    本项目基于TensorFlow框架实现了经典的UNet模型,适用于医学图像分割任务。代码开源,便于研究与学习。 使用TensorFlow实现UNet的项目被称为UNet_with_TensorFlow。
  • Point-Transformer-Pytorch:PytorchPoint Transformer
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    Point-Transformer-Pytorch是一款基于PyTorch框架开发的库,专注于实现点云数据处理中的Point Transformer层。此项目为研究人员和开发者提供了一个高效、灵活且易于使用的工具来探索与应用最新的深度学习技术于三维空间理解任务中。 在Pytorch中实现点变压器-火炬的自注意层可以显著提升点云分类和分割的效果。安装该库使用命令`pip install point-transformer-pytorch`。 导入所需的模块: ```python import torch from point_transformer_pytorch import PointTransformerLayer ``` 定义并初始化PointTransformerLayer,例如设置维度为128、位置MLP隐藏层维数为64以及注意力MLP的隐藏倍率为4。然后生成随机特征和位置数据,并创建一个掩码。 ```python attn = PointTransformerLayer(dim=128, pos_mlp_hidden_dim=64, attn_mlp_hidden_mult=4) feats = torch.randn(1, 16, 128) pos = torch.randn(1, 16, 3) mask = torch.ones(1, 16).bool() ```
  • 3D-Unet:Chainer大脑分割3D Unet
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    本研究利用深度学习框架Chainer实现了3D U-Net模型,专为大脑图像自动分割设计,旨在提高医学影像分析精度与效率。 3D Unet的Chainer实现用于大脑分割任务。培训配置位于configs/base.yml文件内。由于GPU内存限制,我们采用了基于补丁的方法进行训练。该方法要求使用SimpleITK v4,并遵循yaml格式定义网络架构中的3D Unet结构。 为了训练3D Unet模型,请参考以下命令行参数: - `python train.py -h`:显示帮助信息。 - `--gpu GPU, -g GPU`:指定GPU ID(输入负值表示使用CPU)。 - `--base BASE, -B BASE`:程序文件的基本目录路径。 - `--config_path CONFIG_PATH`:配置文件的路径。
  • TensorFlow2.0-Unet: 源ResNet与Unet
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    本项目采用TensorFlow 2.0框架开发,实现了结合ResNet残差网络结构和U-Net架构的医学图像分割模型。代码公开,便于学习与研究。 使用TensorFlow 2.0的UNet和ResNet配置环境,请按照以下步骤操作:安装所需的库(通过运行`-r require.txt`),然后执行`demo.py`脚本以查看结果。具体的操作指南可以在名为说明.txt的文件中找到。