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RootNav 2.0:植物表型分析应用

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简介:
RootNav 2.0是一款先进的软件工具,专门用于自动化和优化植物根系及其他特征的表型分析。通过高效处理图像数据,它帮助研究人员深入理解植物生长与环境适应性之间的关系。 这是RootNav 2.0的代码存储库。在准备发布期间,自述文件和存储库中的代码会每天进行改进,请及时查看新功能及说明文档! **版本更新** - **2020年8月24日 - 版本2.1** - RootNav 2.0 的训练代码得到了显著的优化,使得在新的数据集上训练该工具变得更加容易。 - 新增的功能包括: - 简化的文件夹结构:现在只需传递包含根系统图像和RSML描述的`train` 和 `valid` 文件夹即可开始训练。 - 默认创建并缓存用于训练的遮罩,仅需提供 RSML 描述即可。 - 训练完成后,可以通过运行 `training.py publish` 函数来发布模型,在RootNav 2中使用。 **长期计划** - 其他预训练模型:如果您有特定的数据集需要使用此工具,请联系开发者团队寻求合作。 - 模型和训练代码的持续优化:我们将不断审查现有的架构及培训代码,以期提高性能。

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  • RootNav 2.0
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    RootNav 2.0是一款先进的软件工具,专门用于自动化和优化植物根系及其他特征的表型分析。通过高效处理图像数据,它帮助研究人员深入理解植物生长与环境适应性之间的关系。 这是RootNav 2.0的代码存储库。在准备发布期间,自述文件和存储库中的代码会每天进行改进,请及时查看新功能及说明文档! **版本更新** - **2020年8月24日 - 版本2.1** - RootNav 2.0 的训练代码得到了显著的优化,使得在新的数据集上训练该工具变得更加容易。 - 新增的功能包括: - 简化的文件夹结构:现在只需传递包含根系统图像和RSML描述的`train` 和 `valid` 文件夹即可开始训练。 - 默认创建并缓存用于训练的遮罩,仅需提供 RSML 描述即可。 - 训练完成后,可以通过运行 `training.py publish` 函数来发布模型,在RootNav 2中使用。 **长期计划** - 其他预训练模型:如果您有特定的数据集需要使用此工具,请联系开发者团队寻求合作。 - 模型和训练代码的持续优化:我们将不断审查现有的架构及培训代码,以期提高性能。
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