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基于FCN网络的腹部多脏器5分割实战数据分析

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简介:
本研究运用全卷积神经网络(FCN)技术进行腹部CT图像处理,专注于自动化识别与分割肝脏、肾脏等五种重要器官,提供精准医疗分析支持。 本项目基于FCN网络对腹部多脏器数据集进行处理,并包含数据集、代码及训练好的权重文件。经测试,可以直接使用提供的代码。 该数据集中包括五种器官的分割任务,采用FCN网络经过20个epoch的训练后,在全局像素点准确度上达到了0.99,miou为0.80;若增加训练周期,则性能将进一步提升。 项目中的主要文件如下: 【train.py】此代码会根据标签灰度值自动计算并获取FCN网络输出结果。可以根据不同的任务需求调整超参数backbone(可以选择resnet50或resnet101作为特征提取的主干),同时为了更好的可视化效果,该脚本还会将预处理后的数据保存在指定目录中。 【介绍】学习率采用余弦退火算法进行优化;损失函数选用交叉熵,并使用了收敛速度更快的Adam优化器。训练集和测试集中关于损失值及iou曲线的数据可以在run_results文件夹内查看,此外还保存有详细的训练日志、最佳权重等信息,在这些记录中可以看到每个类别的iou、召回率(recall)、精确度(precision)以及全局像素点准确率。 【predict.py】将待推理的图像放在inference目录下,并直接运行预测脚本即可完成任务。 具体操作方法请参考README文件,即使是初学者也能轻松上手。

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客服
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  • FCN5
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    本研究运用全卷积神经网络(FCN)技术进行腹部CT图像处理,专注于自动化识别与分割肝脏、肾脏等五种重要器官,提供精准医疗分析支持。 本项目基于FCN网络对腹部多脏器数据集进行处理,并包含数据集、代码及训练好的权重文件。经测试,可以直接使用提供的代码。 该数据集中包括五种器官的分割任务,采用FCN网络经过20个epoch的训练后,在全局像素点准确度上达到了0.99,miou为0.80;若增加训练周期,则性能将进一步提升。 项目中的主要文件如下: 【train.py】此代码会根据标签灰度值自动计算并获取FCN网络输出结果。可以根据不同的任务需求调整超参数backbone(可以选择resnet50或resnet101作为特征提取的主干),同时为了更好的可视化效果,该脚本还会将预处理后的数据保存在指定目录中。 【介绍】学习率采用余弦退火算法进行优化;损失函数选用交叉熵,并使用了收敛速度更快的Adam优化器。训练集和测试集中关于损失值及iou曲线的数据可以在run_results文件夹内查看,此外还保存有详细的训练日志、最佳权重等信息,在这些记录中可以看到每个类别的iou、召回率(recall)、精确度(precision)以及全局像素点准确率。 【predict.py】将待推理的图像放在inference目录下,并直接运行预测脚本即可完成任务。 具体操作方法请参考README文件,即使是初学者也能轻松上手。
  • Unet-MobileNet图像代码【含完整代码和集等】
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    本项目提供了一套基于Unet-MobileNet模型进行腹部肝脏图像自动分割的实战教程与代码实现,包含详尽的数据预处理、模型训练及评估步骤,并附有开源代码和数据集。 基于Unet-Mobilenet的腹部肝脏图像分割实战代码提供了完整的数据集及训练脚本,并增加了新的评估指标如loss、iou、dice、recall以及precision及其对应的平均值(mean)。此外,还生成了各类别的曲线图与平均值的曲线图(针对训练集和验证集)。 该项目使用LIver数据集进行模型训练。经过100个epoch后,验证集中各指标如下: - 精确率 (Precision): [0.9846, 0.9590] - 召回率 (Recall): [0.9958, 0.8642] - IoU: [0.9805, 0.8334] - Dice系数: [0.9901, 0.9092] 平均值为: - 平均精确率 (Mean Precision): 0.9718 - 平均召回率 (Mean Recall): 0.9300 - 平均Dice系数 (Mean Dice): 0.9497 - 平均IoU: 0.9070 如需使用自己的数据集进行训练,可以参考项目中的readme文件。
  • Unet与SAM融合提示框Prompt在应用:代码、集及训练成果
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    本研究结合Unet和SAM模型,创新性地引入了提示框Prompt机制,专门应用于腹部多器官的精确分割。通过详细的数据集处理、模型训练以及实验结果分析,展示了该方法在提高分割精度与效率方面的优越性能。文中还提供了实战代码供读者参考学习。 本项目使用PyTorch实现,结合SAM的提示框功能对腹部多脏器进行分割训练与测试。代码包含完整的训练脚本以及一个提供用户界面(UI)的单张图片推理部分,允许通过绘制边界框来完成UNet和SAM模型的联合分割操作。
  • Unet与Resnet在深度学习中应用:五类项目及尺度训练技巧
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    本文探讨了基于Unet和Resnet模型的深度学习技术在腹部多脏器五类分割项目中的应用,并介绍了有效的多尺度训练技巧,以提高模型性能。 本项目为基于Unet+Resnet的多尺度分割实战项目(包含数据集),其中Unet的骨干网络被替换为了ResNet。 **数据集介绍:** 采用的是腹部多脏器5类别的分割数据集,总大小约为363MB。 **项目说明:** 1. **训练脚本自动执行**:train 脚本能自动进行模型训练。代码会将输入的数据随机缩放为设定尺寸的0.5到1.5倍之间,以实现多尺度训练效果。在utils模块中的compute_gray函数中实现了mask灰度值保存至txt文件的功能,并且该脚本还会根据需求定义UNET网络输出通道的数量。 2. **预处理功能**:项目的全部预处理函数都经过了重新设计和优化,在transforms.py 文件中有详细的实现代码供查阅。 3. **训练效果与结果展示**:模型在50个epochs的训练后,miou(平均交并比)达到了约0.84。学习率采用余弦退火策略调整。run_results文件夹内保存了训练集和测试集上的损失值及IoU曲线图,并且利用matplotlib库绘制这些图像结果;此外还保留有详细的训练日志、最佳权重等信息,使得每个类别及其全局像素点的准确度指标(如iou、recall、precision)一目了然。 4. **预测功能**:项目提供了一个推理脚本,能够自动处理inference文件夹下的所有图片进行分割任务。 整个代码库中添加了大量的注释以帮助理解。如果需要训练自己的数据集,请参考README文档中的指南操作即可轻松运行。
  • 15个-Unet2d-master.zip
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    这是一个使用Unet2D架构进行腹部CT图像中15种不同器官自动分割的深度学习项目。代码和预训练模型可在提供的ZIP文件中获取。 Unet2d-master 腹部15个器官分割.zip包含了用于腹部多个器官的分割工具和数据集。
  • PyTorch语义FCN经典代码
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    本项目提供了一个基于PyTorch框架实现的经典全卷积网络(FCN)用于图像的语义分割任务。代码简洁清晰,适合初学者学习和研究使用。 这段文字描述了一段使用Python编写的语义分割代码,该代码基于Pytorch框架,并且完整无误、可以完美运行。
  • Python
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    本书通过实际案例教授读者如何使用Python进行心脏病数据集的分析,涵盖数据清洗、探索性数据分析及建模等内容。适合对医疗数据分析感兴趣的编程爱好者和专业人士阅读。 我们都很害怕生病,但感冒发烧这种从小到大的疾病已经让我们麻木了,因为一星期左右它们就会痊愈。然而随着年龄的增长,各种发炎、三高以及心脏病等问题也随之而来。作为一种发作时令人感到恐惧的疾病,心脏病每年夺走无数生命。那些患病而幸存下来的人们也必须在自己后续的生命中放弃许多东西来预防心脏病再次发生。 没有得病的时候,我们总觉得自己离它很远。我对心脏病的认识就是这样:我不知道它的病因是什么,也不知道哪些因素会引发心脏病;更不知道一旦患病后如何维持正常生活等等问题的答案。今天我在Kaggle上看到一个关于心脏病的数据集(具体下载地址和源码可在文中找到),借此机会重新整理一下这段文字内容,去掉其中的链接信息等。
  • 全卷积(FCN)语义践教程.zip
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    本教程为《基于全卷积网络(FCN)的语义分割实践》,内容涵盖利用深度学习技术进行图像语义分割的方法与技巧,适合对计算机视觉感兴趣的读者深入学习。 FCN通过像素级别的分类解决了语义级别的图像分割问题。与传统的CNN在卷积层之后使用全连接层得到固定长度的特征向量进行分类不同,FCN可以接受任意尺寸的输入图像,并利用反卷积层对最后一个卷积层的feature map进行上采样,使其恢复到和输入图像相同的尺寸,从而能够为每个像素生成预测结果。同时,这种方法保留了原始输入图像中的空间信息,在最终处理后的特征图中实现逐像素分类。本资源提供了FCN的应用实战案例。