
CNVKit.SH:运行 CNVKit 的简洁脚本 - 开源
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简介:
CNVKit.SH 是一个简化版脚本工具,用于执行 CNVKit 软件的各项功能。它旨在提高基因组拷贝数变异分析的效率和便捷性,并且是开源软件。
cnvkit.sh 是一个用于处理 exome-seq 数据的 shell 脚本,它使用由 exome_test.sh 生成的文件来运行 CNVkit。该脚本允许通过平均 log2ratio 对特定染色体的基线进行重新调整。更新后,seg 文件可以通过多线程 cytoband 进行注释,并且可以绘制单个染色体的散点图。
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