Project 3 - Swiss Cheese

简介：
Project 3 - Swiss Cheese 是一个富有创意的设计或研究项目，它或许借鉴了瑞士奶酪独特的孔洞分布模式，用以解决复杂系统中的失误和失效问题。该项目旨在通过多层次防御机制来增强系统的安全性与可靠性。 项目简介 微阵列与RNA-Seq技术在理论上测量的是基因组内mRNA分子的丰度情况，但它们的技术本质不同，并且使用不同的分析方法可能会导致实验结果出现显著差异。因此，在评估基于这两种技术得到的基因表达数据时需要细致的研究设计以控制其他可能影响变异的因素。本研究旨在探讨跨平台间差异基因表达的一致性、测试并比较每种平台在通过治疗机制（MOA）检测预期途径水平效果方面的表现，并利用这些测试来评估每个平台预测MOA准确性的能力。 此项目将重现论文中的结果，特别是图2a和图3b+c部分的内容，并对比文中提到的路径富集分析的结果报告。 贡献者： - 数据负责人： - 程序员： - 分析员： - 生物学家： 储存库内容包括RNA-Seq样品统计与比对信息，使用featureCounts读取计数、通过DESeq2进行RNA-Seq差异表达分析以及利用Limma蛋白完成微阵列差异表达。此外还包含了关于微阵列和RNA-Seq的路径富集比较结果。