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用Python实现简单的层次聚类算法及可视化

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简介:
本文章介绍了如何使用Python语言来实施一个简单的层次聚类算法,并展示了如何对结果进行有效的可视化。 本段落实例展示了如何用Python实现简单层次聚类算法并进行可视化展示。 基本的算法思路是:将当前组间距离最小的两组合并成一组。不同的地方在于确定组件之间距离的方法,常见的有最大距离、最小距离、平均距离和马氏距离等。 以下是相关代码示例: ```python import numpy as np import data_helper np.random.seed(1) def get_raw_data(n): _data = np.random.rand(n, 2) #生成数据的格式是n个(x,y) _groups={idx:[[x,y]] for idx,(x,y) in enumerate(_data)} ```

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  • Python
    优质
    本文章介绍了如何使用Python编程语言来实现一种简单而有效的数据科学方法——层次聚类算法,并展示了如何对其进行结果可视化。通过阅读此教程,读者可以掌握从数据分析到视觉呈现的一整套流程,帮助理解复杂数据集的内在结构和模式。 本段落详细介绍了如何使用Python实现简单的层次聚类算法,并展示了其可视化方法,具有一定的参考价值,供对此感兴趣的读者们参考。
  • Python
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    本文章介绍了如何使用Python语言来实施一个简单的层次聚类算法,并展示了如何对结果进行有效的可视化。 本段落实例展示了如何用Python实现简单层次聚类算法并进行可视化展示。 基本的算法思路是:将当前组间距离最小的两组合并成一组。不同的地方在于确定组件之间距离的方法,常见的有最大距离、最小距离、平均距离和马氏距离等。 以下是相关代码示例: ```python import numpy as np import data_helper np.random.seed(1) def get_raw_data(n): _data = np.random.rand(n, 2) #生成数据的格式是n个(x,y) _groups={idx:[[x,y]] for idx,(x,y) in enumerate(_data)} ```
  • 使PythonK-means、PCA降维和
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    本项目采用Python编程语言,实现了K-means聚类、主成分分析(PCA)降维及层次聚类三种经典数据挖掘技术。通过这些方法可以有效地对大量复杂数据进行分类与简化处理。 中科大2019年春季AI实验二涵盖了Kmeans算法、PCA算法和层次聚类算法。
  • K-means、DBSCAN
    优质
    本项目实现了三种经典的无监督学习聚类算法——K-means、层次聚类和DBSCAN,并通过可视化手段展示了它们的工作原理与特性。 本段落介绍了K-means、层次聚类和DBSCAN三种聚类算法在Java中的实现方法。
  • Python(AGNES)
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    简介:AGNES是一种层次聚类方法,用于Python中基于相似性或距离对数据进行分组。该算法自底向上逐步合并最接近的数据点群,形成层级结构。 层次聚类(AGNES)算法是聚类算法的一种实现方式。该方法通过计算不同类别数据点间的相似度来构建一棵有层次的嵌套聚类树。在这棵树里,最底层代表原始的数据点集合,而顶层则是一个包含所有簇的根节点。当处理需要大量簇或存在连接限制的情况时,AGNES算法是一种常用的解决方案。
  • 代码.zip__MATLAB_代码
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    本资源提供了一套使用MATLAB编写的层次聚类算法代码。通过该代码,用户可以便捷地进行数据分层和集群分析,适用于科研及工程应用中对复杂数据集的处理需求。 用MATLAB实现层次聚类法,不是通过调用库函数完成的,而是严格按照算法原理一步步编写代码来实现的。
  • Python中凝例分析
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    本篇文章详细介绍了如何在Python中实现凝聚层次聚类算法,并通过具体实例进行分析。适合数据分析和机器学习初学者参考。 本段落主要介绍了Python聚类算法中的凝聚层次聚类原理及其使用技巧,具有一定的参考价值。需要了解相关内容的朋友可以参考这篇文章。
  • C/C++AGNES
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    本项目采用C/C++语言实现了AGNES(Agglomerative Nesting)层次聚类算法,通过自底向上的策略逐步合并数据点以构建层级簇结构。 AGNES聚类法的基本算法部分使用结构体数组来存放测试数据,并利用LIST容器及迭代器辅助进行聚类操作。代码中的注释采用UTF-8编码格式,在Linux环境下可以直接查看,而在Windows系统中需要先转换文件的编码格式以正常显示。
  • Java语言中
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    本论文探讨了在Java编程环境中实现层次聚类算法的方法和技术。通过分析和比较不同的层次聚类策略,本文提供了具体的代码示例,并详细解释其工作原理与应用场景。 层次聚类算法的Java实现采用了控制台输出,并且也创建了txt文档进行输出。
  • BIRCH
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    BIRCH层次聚类算法是一种高效的数据聚类方法,特别适用于大规模数据集。通过构建一个能够容纳大量信息的树状结构,它能够在一次或多次扫描数据后生成高质量的簇摘要,从而有效减少计算复杂度和空间需求。 **BIRCH聚类算法详解** BIRCH(Balanced Iterative Reducing and Clustering using Hierarchies)是一种高效且可伸缩的层次聚类方法,特别适用于大规模数据集处理。该算法的主要特点在于其分层构建过程和对局部特征的有效表示,这使得它在处理大数据时具有较高的时间和空间效率。 ### 一、BIRCH算法的基本概念 1. **局部特征直方图(CLUSTER FEATURE)**:BIRCH的核心是使用CLUSTER FEATURE (CF)。这是一种紧凑的数据结构,用于存储子样本集的信息。每个CF包含两个主要部分:样本数量(N)和中心化及规范化累积向量(CS),通过不断合并子样本集,CF可以逐步表示更大的聚类。 2. **层次结构的构建**:BIRCH算法在迭代过程中逐渐建立层级结构。每次新数据点到来时,会与现有的CF进行比较,并根据相似性来决定是将该数据点加入到一个已存在的CF中还是创建一个新的CF。这一过程确保了每个节点的数据分布较为平衡,从而避免了一个单独的节点过于庞大导致内存消耗过多的问题。 3. **存储效率**:BIRCH使用固定大小的CF结构来存储数据信息,即使面对庞大的数据集也能有效控制内存占用情况,这使得它在大数据场景下具有优异的表现能力。 ### 二、BIRCH算法流程 1. **初始化阶段**: 开始时每个样本作为一个独立的CLUSTER FEATURE (CF)。 2. **合并过程**:当新来的样本到达时,会与现有的CF进行对比。如果该样本和某个已存在的CF之间的距离小于预设阈值,则将此样本添加到对应的CF中;反之则创建一个新的CF并加入这个新的数据点。 3. **更新CLUSTER FEATURE**: 每次合并操作后都需要对相应的N(数量)以及CS(累积向量)进行修正以反映最新的信息状态。 4. **层次构建**:重复上述的步骤直到所有样本都被处理完毕,最终会形成一棵由CF节点构成的树状结构即为所求得的层级体系。 5. **生成最终聚类结果**: 通常需要借助其他类型的聚类算法(例如谱聚类或DBSCAN)来对生成出来的层次化模型进行剪枝操作以获得最佳效果。这是因为BIRCH本身并不能直接确定最合适的簇数。 ### 三、BIRCH的优点与缺点 **优点**: 1. **高效性**: BIRCH无需全局扫描数据,只需顺序读取即可完成处理任务,大大降低了计算成本。 2. **可扩展性强**: 固定大小的CF使得它能够轻松应对大规模的数据集挑战。 3. **内存友好型**: 通过避免一次加载所有原始数据的方式减少了对系统资源的需求。 **缺点**: 1. **聚类质量较低**: 相比于其他算法(如K-Means或谱聚类),BIRCH生成的最终结果可能不够理想。 2. **依赖后续剪枝策略**: BIRCH构建出来的层次结构需要通过额外的方法来完成最后一步优化,这就增加了复杂性和不确定性。 ### 四、应用与扩展 BIRCH算法在数据挖掘、推荐系统及图像分析等多个领域都有广泛的应用。由于其高效的特性,它常常被用作预处理步骤为后续的深入分析提供初步聚类结果。此外,也有研究人员对BIRCH进行了改进和优化(如调整CF结构或合并策略),以期进一步提高聚类准确性和效率。 总结来说,凭借独特的数据表示方式与层次构建方法,BIRCH成为了一种有效工具来处理大规模的数据集问题;尽管其在某些方面的表现可能不如同类算法优秀,但它的高效性以及对内存管理的优势使其成为一个值得考虑的选择。