Advertisement

甲基化分析流程(R语言)+代码

  •  5星
  •     浏览量: 0
  •     大小:None
  •      文件类型：None

简介：
本课程详细介绍利用R语言进行甲基化数据分析的全流程，包括数据预处理、统计分析及可视化等，并提供配套代码供学员实践。 使用Bioconductor的相关包对甲基化数据进行一系列分析，并提供具体的代码示例。

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~
客服
客服
客服关闭
  • 甲基化分析流程(R语言)+代码
    优质
    本课程详细介绍利用R语言进行甲基化数据分析的全流程，包括数据预处理、统计分析及可视化等，并提供配套代码供学员实践。 使用Bioconductor的相关包对甲基化数据进行一系列分析，并提供具体的代码示例。
     
  • methylKit：DNA甲基化分析的R包工具
    优质
    methylKit是一款用于高通量DNA甲基化数据分析的R语言软件包。它为研究人员提供了一套全面的功能，包括数据预处理、位点和区域水平上的甲基化模式识别以及差异甲基化区域检测等服务，助力深入理解表观遗传学机制。 methylKit是一个用于DNA甲基化分析及高通量亚硫酸氢盐测序数据注释的软件包。它可以处理不同类型的测序数据，并支持靶标捕获方法，如序列捕捉技术等。此外，该工具还能够解析5hmC（5-羟甲基胞嘧啶）在碱基对分辨率上的信息，适用于Tab-seq或oxBS-seq获得的数据。如果提供正确的输入格式，它同样可以处理全基因组亚硫酸氢盐测序数据。 methylKit的主要功能包括： 1. 覆盖率统计 2. 甲基化统计分析 3. 样本相关性和聚类差异甲基化分析 4. 功能注释和访问器/强制功能应用 5. 多种可视化选项，如区域和平铺窗口分析 该软件包还具备以下特性： - 支持从对齐文件中直接读取甲基化调用数据。 - 提供批量效果控制、多线程支持（以加快差异甲基化计算）等功能。 - 兼容GenomicRanges对象，可以从通用文本段落件中导入甲基化百分比数据。 用户可以通过订阅googlegroups页面来获取关于新版本和功能更新的最新信息。
     
  • R语言_方差分析及其代码_
    优质
    本文详细介绍了如何使用R语言进行方差分析，并提供了相应的代码示例。通过学习本教程，读者可以掌握数据分析中的方差分析方法。 方差分析（Analysis of Variance，简称ANOVA），又称“变异数分析”，是由R.A.Fisher发明的，用于检验两个或更多样本均数之间的显著性差异。由于各种因素的影响，研究所得的数据呈现波动状。造成这种波动的原因可以分为两类：一类是不可控的随机因素；另一类是在研究中施加并对结果产生影响的可控因素。
     
  • 关于差异基因分析的R语言代码
    优质
    本简介介绍了一系列用于执行差异基因表达分析的R语言代码。这些代码通过统计模型识别在不同条件或样本组之间显著变化的基因，适用于生物信息学研究中的RNA测序数据处理和解析。 资源很有用，希望能对大家有所帮助。希望大家能够共享好资源。
     
  • R语言统计分析基础案例与代码
    优质
    本书通过丰富的实例和详细的代码解析，帮助读者掌握R语言在统计分析中的应用技巧。适合初学者及进阶学习者参考使用。 R语言数据分析案例展示了如何利用R语言进行数据处理、分析及可视化的过程。通过实际的项目演示了从数据导入到结果解释的一系列步骤，帮助学习者掌握使用R语言解决具体问题的方法和技术。 这样的例子通常会涵盖统计建模、机器学习算法的应用以及图形表示等多个方面，为初学者提供了一个全面了解数据分析流程的良好起点。
     
  • R语言中的聚类分析代码.txt
    优质
    本文件提供了详尽的指导和示例代码，用于在R语言环境中进行聚类分析。内容涵盖了多种聚类方法及其应用实例。 应用多元统计分析中的聚类分析可以通过R语言代码实现。这里提供的代码与《多元统计分析与R语言建模》课本配套使用。
     
  • R语言文本分析实例代码.rar
    优质
    本资源包含使用R语言进行文本分析的实用代码示例，涵盖数据预处理、特征提取及模型构建等环节，适用于初学者学习和实践。 该资源是2020年参加美国数学竞赛（美赛）所用的代码，主要功能包括文本分析、LDA主题模型、词云生成以及分类统计和时间序列分析。资源中包含原始数据及详细的代码说明。
     
  • 【R语言实战教程代码】-2000_2018年GDP分析.zip
    优质
    本资料包提供一份详细的R语言实战教程，专注于使用R进行经济数据分析。内容涵盖如何利用R软件解析并可视化自2000年至2018年的全球或特定国家的年度GDP数据，帮助用户掌握高级的数据处理技巧和统计方法。 【R语言应用实战代码】-GDP2000_2018分析.zip