
高斯扩散模型在Matlab中的实现,帕尔迪代码。
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简介:
高斯扩散模型在MATLAB环境中的代码自述文件,并行高角度分辨率扩散成像(pHARDI)是一个用于从扩散磁共振成像(dMRI)数据中进行重建的工具包,该工具包利用GPU/CPU加速技术。其设计目标是支持多种硬件设备上的多个线性代数加速器,例如多核GPU设备(基于CUDA和OpenCL),甚至可以利用协处理器(如Intel Xeon Phi)进行加速。同时,对于无法利用任何GPU加速器的平台,该解决方案也能通过高度可调的线性代数库在多核处理器(CPU)上高效运行。为了实现线性代数加速,我们采用了Armadillo作为通用的接口,并借助ArrayFire以支持GPU设备。该重建方法清单包括:具有对称正定约束的扩散张量成像(DTI-SPD)(Barmpoutis, 2010年);Q球成像(QBI)(Tuch, 2004;Descoteaux, 2007);恒定立体角Q球成像(QBI-CSA)(Aganj, 2010);扩散方向转换(DOT-R2)的修订版(Canales-Rodríguez, 2010a);广义Q采样成像(GQI)(Fang-Cheng, 2010年);以及扩散光谱成像(DSI)(Wedeen, 2005; Ca
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