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DNA翻译器:将 DNA 序列转化为对应的氨基酸序列(MATLAB开发)。

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简介:
DNAtranslator 是一款专门设计用于将 DNA 序列精确转化为对应蛋白质序列的微型工具。该工具能够接收原始的 DNA 序列作为输入,例如 DNAtranslator(ACTGTTACCGAATCA),或者接受保存序列的纯文本文件,如 DNAtranslator(cdna.txt)。 在提供的压缩包中,您会发现一个名为 cdna.txt 的示例文件,它详细展示了 SBDS 基因的 cDNA 序列信息。

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客服
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  • DNA:使用MatlabDNA
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    本项目利用MATLAB编程实现DNA序列到蛋白质氨基酸序列的转换。通过编码规则,输入DNA序列,输出对应的多肽链,便于生物信息学研究与应用。 DNAtranslator 是一个将 DNA 序列转换为相应蛋白质序列的小功能。它可以通过输入原始 DNA 序列(例如 ACTGTTACCGAATCA),或通过提供包含所需序列的纯文本段落件(如 cdna.txt)来实现此操作。在提供的压缩文件中,您会找到名为 cdna.txt 的演示文本段落档:它是 SBDS 基因的 cDNA 序列。
  • DNA
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    简介:本项目专注于生物信息学领域中的基础环节——从DNA序列中解析编码区,并将其转换为对应的蛋白质氨基酸序列。通过计算机算法精确预测基因表达产物,以支持药物开发、遗传疾病研究等应用。 这段文字描述的是一个使用Smith算法进行DNA序列比对的Perl代码。只需提交输入即可开始比较和对比过程。
  • DNA Translate: DNA 核苷工具 - MATLAB
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    DNA Translate是一款使用MATLAB开发的实用工具,能够高效地将DNA核苷酸序列转化为对应的蛋白质氨基酸序列,适用于生物学和分子遗传学的研究与教学。 此功能的目的是将DNA核苷酸翻译成它们所对应的氨基酸。其工作原理是搜索起始密码子(蛋氨酸),然后从那里开始进行翻译。当到达终止密码子后,它会寻找下一个起始密码子并重复这一过程直到遍历完整个输入序列dnaVec。 输入: - dnaVec:这是一串需要被识别的DNA核苷酸,并将其翻译成氨基酸。 输入应全部小写且看起来像mRNA链一样使用尿嘧啶代替胸腺嘧啶,因为其与有义链相似。 输出: - amino_acids:这是从dnaVec中所有外显子对应的氨基酸序列。包括蛋氨酸和终止信号在内的所有氨基酸都将被包含在内。
  • DNA至蛋白DNA蛋白质
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    DNA至蛋白转换器是一款创新软件工具,专门用于解析基因信息,能够高效准确地将DNA序列转化为对应的氨基酸序列。它简化了生物信息学研究中的复杂计算过程,为遗传工程和分子生物学的研究提供了有力支持。 项目简介 根据以下强制性要求编写一个计算机程序(可使用任何脚本语言)来将分配给您的DNA序列(以.fasta格式提供;请参阅附录),转换为蛋白质序列: 1. 蛋白质的最小长度应为44个氨基酸。 2. 对于蛋白质的最大长度没有限制。 3. 如果输入文件不是.fasta格式,则程序需抛出消息“输入文件不是.fasta格式”。 4. 若给定的文件包含非DNA字符,程序则需要引发一条消息:“输入文件不包含DNA序列数据”。 提交内容应包括: - 您编写的代码 - 一个.txt、.doc或.pdf文档,其中包含: - 发现的蛋白质总数 - 在不同长度范围下发现的蛋白质数量:44至100个氨基酸;100至500个氨基酸;超过500个氨基酸 项目管理员 :red_heart: 祝您编码愉快 :man::laptop: 请记得给代码点赞,如果您喜欢的话。
  • DNA蛋白质
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    本项目专注于探索DNA序列如何通过转录和翻译过程转化为蛋白质序列。研究包括基因表达调控机制及遗传密码解读,旨在加深对生物信息学的理解与应用。 该Perl程序采用六框翻译法将DNA序列转换为蛋白质序列,详细使用方法可在程序的前几行找到。
  • 符号FASTA格式蛋白质
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    本研究探讨了一种方法,用于将氨基酸符号序列有效转换为标准FASTA格式的蛋白质序列。此过程对于生物信息学分析至关重要。 氨基酸符号序列可以转换为FASTA格式的蛋白质序列。只需将英文氨基酸序列粘贴到窗口并按回车键即可输出转换结果。
  • 局部比DNA算法
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    简介:局部比对的DNA序列算法是一种用于识别两个或多个DNA序列间相似区域的技术方法,它在生物信息学中被广泛应用于基因功能预测、进化关系研究及遗传变异分析等领域。 Smith-Waterman算法的实现涉及配对、错位和缺失后得到的分值计算。
  • DNA分类法
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    DNA序列的分类法是指利用生物信息学方法对基因组数据进行分析和归类的技术体系。通过比较不同物种或个体间的DNA碱基序列相似性,构建进化树并识别功能区域,为遗传研究提供重要工具。 本段落探讨了A题中的DNA序列分类问题。首先从“不同序列中碱基含量差异”入手建立了欧氏距离判别模型、马氏距离判别模型以及Fisher准则判定模型;随后,基于“不同序列中碱基位置的差别”,提出了利用序列相关知识的相关度分类判别算法,并进一步研究了带反馈机制的相关度分类方法。针对题目提供的待分类的人工序列和自然序列,本段落进行了详细的分类工作。此外,还对其他常见的分类算法进行了讨论,并特别关注了几种主要方法在稳定性方面的比较分析。
  • JavaScript DNA动态代码
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    本项目提供了一套基于JavaScript实现的DNA序列比对算法库,适用于生物信息学领域中进行快速、准确的基因序列分析和研究。 我用JavaScript编写了一个动态序列比对的代码,只是随意尝试一下,并非正式项目或应用。在网上看到类似算法多是用VC、VB编写的,而这个算法我在高中课本上见过,所以想试着用Js实现一遍,可能还不太准确。
  • DNA-FASTA-Python:用Python解析多Fasta格式DNA
    优质
    本项目利用Python语言实现对多种Fasta格式DNA序列文件的高效解析与处理,适用于生物信息学研究。 使用Python分析Multi-Fasta格式的DNA序列的一个程序可以接收包含多个FASTA格式DNA序列文件作为输入,并解决以下问题: 1. 文件中有多少条记录? FASTA中的每一条记录由一个标题行(以>符号开头)和随后的一系列数据行组成。在第一列中,>之后的第一个单词是该序列的标识符,其余部分则为可选描述。 2. 计算文件中所有序列长度总和。 3. 确定最长及最短的序列分别是什么?如果有多个同长或同短的序列,则需要找出这些序列及其对应的标识符。 FASTA格式是一种用于表示生物分子(如DNA、RNA或蛋白质)的一组或多组序列的标准文本段落件格式。每个序列都由一个描述行开始,然后跟随一系列数据行。描述行必须以>符号开头,并且在>和第一个单词之间不应有空格存在。 例如: ``` >AB000263 | ACC = AB000263 | DESCR GATCGTACGTAGCTAGCATGC... ```