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RFOVE-细胞分割:利用区域重叠椭圆拟合及其在细胞分割的应用-MATLAB开发

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简介:
本项目介绍了一种创新的细胞分割技术——区域重叠椭圆拟合(RFOVE),并提供了其在MATLAB环境下的实现代码,适用于生物学和医学图像处理研究。 这段代码实现了Method RFOVE的简单版本,它是用于细胞分割的基于区域的重叠椭圆拟合方法的应用。RFOVE是完全无监督的,不需要对对象形状进行任何假设或先验知识即可运行,并且扩展并改进了递减椭圆拟合算法(DEFA)。RFOVE和DEFA都通过执行模型选择来解决多椭圆拟合问题,该过程由基于适当定义的形状复杂性度量的Akaike信息准则最小化指导。然而,与DEFA相比,RFOVE使用一个目标函数进行优化,这允许具有更高重叠程度的椭圆组合,并因此能够提供更好的基于椭圆的形状近似效果。 您可以参考文献[1]以获取更多详细信息。 文件:runRFOVE.m: 方法的具体实现。如果您在研究中引用我们的论文 [1],我们将不胜感激: [1] C. Panagiotakis 和 AA Argyros,“基于区域的重叠椭圆拟合及其应用于细胞分割”,图像和视觉计算,Elsevier出版社。

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客服
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  • RFOVE--MATLAB
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    本项目介绍了一种创新的细胞分割技术——区域重叠椭圆拟合(RFOVE),并提供了其在MATLAB环境下的实现代码,适用于生物学和医学图像处理研究。 这段代码实现了Method RFOVE的简单版本,它是用于细胞分割的基于区域的重叠椭圆拟合方法的应用。RFOVE是完全无监督的,不需要对对象形状进行任何假设或先验知识即可运行,并且扩展并改进了递减椭圆拟合算法(DEFA)。RFOVE和DEFA都通过执行模型选择来解决多椭圆拟合问题,该过程由基于适当定义的形状复杂性度量的Akaike信息准则最小化指导。然而,与DEFA相比,RFOVE使用一个目标函数进行优化,这允许具有更高重叠程度的椭圆组合,并因此能够提供更好的基于椭圆的形状近似效果。 您可以参考文献[1]以获取更多详细信息。 文件:runRFOVE.m: 方法的具体实现。如果您在研究中引用我们的论文 [1],我们将不胜感激: [1] C. Panagiotakis 和 AA Argyros,“基于区域的重叠椭圆拟合及其应用于细胞分割”,图像和视觉计算,Elsevier出版社。
  • MATLAB计数_Bb.zip_水岭算法_水岭
    优质
    本资源包提供了一种基于MATLAB的细胞图像处理技术,采用分水岭算法进行细胞自动识别与精确计数。通过先进的图像分割方法,有效提高细胞分析效率和准确性,适用于生物医学研究领域。 采用中值滤波和分水岭法去除小面积区域来实现紫色细胞的计数。
  • 和计数
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    细胞的分割和计数主要介绍在生物医学领域中用于分析显微图像的技术与方法,包括自动化的细胞识别、跟踪及量化过程,助力科研人员高效处理大规模数据。 使用MATLAB进行细胞分割与计数可以采用大津阈值法。这种方法能够有效地将细胞从背景中分离出来,并对图像中的细胞进行准确的计数。在实现过程中,首先需要预处理原始图像以增强对比度并减少噪声的影响;然后应用大津阈值算法确定最佳二值化阈值;最后通过形态学操作和连通域分析来识别和标记每个独立的细胞单元,从而完成对细胞数量的统计工作。
  • 】基于水岭算法与计数MATLAB源码(含GUI).zip
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    本资源提供了一套利用分水岭算法实现细胞图像自动分割和计数的MATLAB代码,附带图形用户界面(GUI),便于操作和分析。适合生物医学工程研究者使用。 【细胞分割】基分水岭算法实现细胞分割计数matlab源码含 GUI.zip
  • 】基于水岭算法与计数MATLAB源码(含GUI).md
    优质
    这段文档提供了一个使用MATLAB编写的基于分水岭算法进行细胞图像分割和计数的完整解决方案,包含用户图形界面(GUI),便于科研人员及学生在生物医学图像处理中应用。 【细胞分割】基分水岭算法实现细胞分割计数matlab源码含 GUI.md 该文档介绍了使用基于分水岭算法的MATLAB代码进行细胞图像的自动分割与计数的方法,同时包含了一个图形用户界面(GUI)以便于操作和展示结果。
  • 图像题报告与MATLAB源码.zip
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    本资源包含细胞图像分割的相关研究内容,包括详细的开题报告和基于MATLAB的完整代码。适合科研人员及学生学习参考。 细胞图像分割是生物医学图像分析领域的一个重要课题,在疾病诊断、药物研发以及细胞生物学研究中发挥着关键作用。本项目围绕“细胞图像分割”展开,并提供了相关的开题报告和MATLAB源码,旨在帮助研究人员和学生理解并实现自动化的细胞图像分割技术。 开题报告通常包括以下几个部分: 1. **背景与意义**:作为生命的基本单位,对单个细胞的精确分割有助于科学家了解其结构、功能及动态变化。传统方法如显微镜观察受限于人为因素的影响,而计算机辅助的图像分割技术可以提高精度和效率。 2. **技术概述**:细胞图像分割涉及多个领域,包括但不限于图像处理、机器学习以及深度学习等。常用的方法有阈值分割、边缘检测(例如Canny算法)、区域生长法、水平集方法及基于模型的技术(如GrabCut);此外还有近年来流行的深度学习方法(比如U-Net和Faster R-CNN)。 3. **研究目标**:确定最适用于特定细胞图像的优化分割算法,提高其精度与鲁棒性,并减少噪声及其他背景干扰的影响。 4. **技术路线**:数据预处理阶段包括去噪、对比度增强及二值化等步骤;选择或设计合适的分割方法并进行效果比较实验;评估和改进算法性能,例如使用IoU(Intersection over Union)指标来衡量结果质量。 5. **预期成果**:开发一套有效的细胞图像分割工具,并提供一个易于使用的MATLAB界面以供科研工作者应用。 在提供的MATLAB源码中可能包含以下内容: 1. **预处理模块**:利用MATLAB的图像处理工具箱执行如高斯滤波、中值滤波及直方图均衡化等操作进行数据准备。 2. **分割算法实现**:根据开题报告中的建议选择或设计具体的分割技术,包括Otsu阈值法、区域生长方法或者基于深度学习的模型。对于后者,则需训练和调整网络参数。 3. **后处理模块**:对初步得到的结果进行修正工作如去除过分割或欠分割现象以及连接断裂处等操作。 4. **评估模块**:使用精度、召回率及F1分数等评价指标来量化并优化算法性能。 5. **用户界面构建**:开发MATLAB GUI,使非编程背景的人员也可以方便地加载图像资料、选择相应算法并且查看最终结果。 通过深入研究和实践这些提供的MATLAB源代码,学习者不仅能掌握细胞图像分割的相关理论知识,并且还能增强实际编码技能。这将有助于他们未来从事科研工作时打下坚实的基础;同时,这种开放资源还有利于促进学术界内部的交流与合作,进而推动该领域的持续发展。
  • 基于PytorchUNet++医学
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    本文探讨了利用Pytorch框架下的UNet++模型,在医学图像处理领域中对细胞进行精确分割的应用情况,展示了其高效性和准确性。 本段落《图像分割:Pytorch实现UNet++进行医学细胞分割》提供了完整项目的代码,涵盖了使用PyTorch框架构建和训练UNet++模型的详细步骤,以应用于医学图像中的细胞分割任务。项目中包括了数据预处理、网络架构设计、损失函数定义以及评估指标计算等关键环节的具体实现方法。
  • 粘连方法
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    本研究提出了一种新颖的图像处理技术,专注于改善细胞粘连区域的精确分割,以促进生物学和医学领域的深入分析。 该程序在粘连细胞的分割上表现良好,采用了极限腐蚀和分水岭方法,算法设计简洁明了,非常适合初学者学习使用。
  • Matlab图像代码
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    本段代码展示了如何使用MATLAB对细胞图像进行精确分割。通过利用先进的图像处理技术与算法,可以有效地识别并分离复杂背景下的单个细胞,为生物医学研究提供强有力的数据支持。 此代码中的m文件内容是对细胞图像进行分割处理,包括前期预处理、分割出细胞核,并在后期对细胞进行计数。该程序还具有一定的黏连细胞分离功能,对于图像处理相关初学者有一定的帮助。
  • 中值滤波与水岭算法进行计数MATLAB代码.zip
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    本资源提供了一套基于MATLAB实现的细胞图像处理方案,通过应用中值滤波和分水岭变换技术来精确地识别并统计细胞数量。该工具包适用于生物医学研究领域内的细胞分析工作,能够有效提升细胞计数与分割的准确性和效率。 【细胞分割】基于中值滤波+分水岭法实现细胞计数的MATLAB源码ZIP文件。