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BRMS:基于Stan的贝叶斯广义多元非线性多层次模型R包

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简介:
BRMS是一款利用Stan引擎实现贝叶斯统计分析的R软件包,特别适用于构建复杂的广义多元非线性多层次模型,为用户提供灵活且高效的建模解决方案。 brms程序包提供了一个接口,使用Stan来拟合贝叶斯广义(非)线性多元多级模型。这个C++程序包执行完整的贝叶斯推理。公式语法与lme4软件包相似,为回归分析提供了熟悉且简单的界面。brms支持广泛的响应分布,使用户能够在多级上下文中拟合各种类型的模型,包括但不限于:线性、稳健线性、计数数据、生存时间、反应时间、有序和零膨胀等模型以及自定义混合模型。此外,它还提供非线性和光滑项的建模选项,并支持缺失值插补及自相关结构。 brms允许预测响应分布的所有参数以执行分布回归,并且可以拟合具有多个响应变量的多变量模型。用户可以根据自己的实际信念灵活地指定先验规范。该程序包提供了评估模型拟合度的方法,包括后验预测检查、交叉验证和贝叶斯因素比较等工具。

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  • BRMSStan广线R
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    BRMS是一款利用Stan引擎实现贝叶斯统计分析的R软件包,特别适用于构建复杂的广义多元非线性多层次模型,为用户提供灵活且高效的建模解决方案。 brms程序包提供了一个接口,使用Stan来拟合贝叶斯广义(非)线性多元多级模型。这个C++程序包执行完整的贝叶斯推理。公式语法与lme4软件包相似,为回归分析提供了熟悉且简单的界面。brms支持广泛的响应分布,使用户能够在多级上下文中拟合各种类型的模型,包括但不限于:线性、稳健线性、计数数据、生存时间、反应时间、有序和零膨胀等模型以及自定义混合模型。此外,它还提供非线性和光滑项的建模选项,并支持缺失值插补及自相关结构。 brms允许预测响应分布的所有参数以执行分布回归,并且可以拟合具有多个响应变量的多变量模型。用户可以根据自己的实际信念灵活地指定先验规范。该程序包提供了评估模型拟合度的方法,包括后验预测检查、交叉验证和贝叶斯因素比较等工具。
  • 参数化应用
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    简介:本文探讨了非参数贝叶斯模型在多级结构中的应用,通过构建复杂的概率图模型,深入研究其在数据挖掘与机器学习领域的潜力。 层次化非参数贝叶斯模型方面有一篇非常经典的论文,内容详尽丰富,接近50页长。
  • 估计Matlab代码-HMeta-d:
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    贝叶斯估计的Matlab代码-HMeta-d提供了一种基于层次元模型进行贝叶斯估计的方法。该工具箱适用于复杂数据结构下的参数估计,尤其在医学影像分析中表现出色。通过HMeta-d框架,用户能够利用先验知识有效提升模型预测准确性,并支持大规模数据分析需求。 贝叶斯估计matlab代码HMeta-d分层meta-d模型(HMeta-d)是由史蒂夫·弗莱明开发的MATLAB工具箱,在一个分层贝叶斯框架中实现了Maniscalco与Lau于2012年提出的meta-d模型。该工具箱结合了Matlab和JAGS,后者是一种用于任意贝叶斯模型进行MCMC推理的程序。提供了有关方法及在分层贝叶斯框架下估算meta-d的优势的信息。 为了更好地理解贝叶斯认知模型,请参考Lee与Wagenmakers所著《贝叶斯认知模型:实践课程》。该HMeta-d模型基于Michael Lee关于1类SDT参数的贝叶斯估计的工作成果,设计为用户无需编写大量代码即可直接使用,并且数据格式与Maniscalco和Lau工具箱一致,便于两者之间的切换比较。 需要注意的是,在运行MATLAB代码之前,请确保已安装JAGS(一种类似于BUGS的MCMC语言)。为了使该程序正常工作,您需要安装JAGS 3.4.0版本而非其他版本。
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  • 变量回归预测】方法线回归
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    本项目采用贝叶斯统计框架下的线性回归模型进行多变量数据预测分析,旨在探索各自变量对因变量的影响及其不确定性。 内容概要:基于贝叶斯线性回归模型实现多变量回归预测 原理: 贝叶斯线性回归是一种利用贝叶斯推断方法来估计参数的线性回归技术,在处理多个自变量与因变量关系时尤为有用。具体步骤如下: 1. 设定先验分布和似然函数:假设数据间的关系为线性的,并给出模型参数的高斯分布作为先验。 2. 应用贝叶斯推断计算后验概率,即在给定观测值的情况下更新参数的概率分布。 3. 通过获取后验均值与方差来估计参数。 4. 利用所得的后验分布进行预测。对于新的自变量数据点,我们可以根据模型计算出因变量的可能取值范围及其不确定性。 适用场景及目标: - 在小样本情况下提升准确性:当可用的数据量有限时,传统的统计方法可能会产生偏差或不准确的结果;而贝叶斯框架允许通过引入先验知识来改善估计效果。 - 分析参数的不确定性:该模型能提供关于各参数可靠性的度量方式,这有助于评估预测结果的质量和可信程度。 - 预测目标变量并量化其不确定范围:借助于贝叶斯线性回归技术可以对未来的观测值做出推断,并给出相应的置信区间。
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