IRDiff 详尽评测报告及可执行项目代码

简介：
本报告提供对IRDiff工具的全面评测，包括其功能、性能和适用场景分析，并附带可供直接运行的相关示例代码。 IRDiff 是一个基于蛋白质-配体相互作用的检索增强 3D 分子扩散模型，能够生成具有目标特性的分子。该模型利用一组特定参考配体来引导扩散过程，以产生符合预期性质的新分子。 本段落档详细记录了项目测评的过程及结果，包括训练完成的模型、修正后的代码、错误报告及其修改位置和方法、缺失文件补充以及测试案例等信息。经过改进的代码能够根据指定蛋白口袋体系利用IRDiff模型生成新分子，并计算vina_score, vina_docking_score, qvina_score, QED及SA等多种指标。此外，该版本还支持使用自定义数据集对模型进行微调训练。 文档中还包括了个人分析和注释内容，便于进一步修改和完善现有模型。