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一个基于Python实现的面向对象MCMC类,用于贝叶斯推理。

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简介:
lwMCMC,一种轻量级马尔可夫链蒙特卡洛算法,利用NumPy和Metropolis Hastings方法,对参数空间进行采样,从而实现高效的参数探索。该软件包采用灵活的布局许可证,其README文件(您当前正在阅读的文档)详细说明了软件包的安装和使用方法。此外,它还包含了关于软件包安装和使用的全面文档。lwMCMC在贝叶斯建模的应用中表现出色。库代码本身经过精心设计,并附带单元测试案例,例如:利用贝叶斯推断进行实验地球物理建模,以获取后验分布、等高线以及MCMC先验坡度与幂律蠕变模型之间的关系(参考冰致密实的幂律流模型)。网格条目清晰地展示了参数的一维后验分布,同时提供了具有一个和两个sigma建模误差轮廓的成对投影。在先验斜率参数为1.8±0.225的情况下,贝叶斯推断结果表明斜率为1.70±0.17。另一个示例包括使用贝叶斯推断进行粒子衰减建模后验分布以及等高线MCMC与事先的为粒子相结合的应用场景。

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    简介:ltwMCMC是一款专为Python设计的面向对象贝叶斯推理工具包,它提供了一系列灵活而强大的MCMC类,便于构建复杂的统计模型。 lwMCMC是一款轻量级马尔可夫链蒙特卡洛工具,基于NumPy和Metropolis-Hastings算法进行参数空间采样。该软件包包括README.md文件、安装指南以及文档。 先决条件: 为了使用此软件包,请确保已经安装了PIP程序脚本。 内容布局如下: - README.md:您正在阅读的关于如何使用lwMCMC的信息。 - 安装和使用指南 - 贝叶斯建模用例 - 库代码本身 - 单元测试案例 示例1展示了利用贝叶斯推断进行实验地球物理模型后验分布等高线的绘制,以及通过幂律蠕变恢复冰致密实的参数约束。该图显示了我们参数的一维后验分布和具有一个及两个sigma建模误差轮廓的成对投影。在先验斜率为1.8±0.225的情况下,贝叶斯推断得出的斜率是1.70±0.17。 示例2则展示了使用贝叶斯方法进行粒子衰减模型后验分布等高线绘制,并且适合于事先定义好的情况下的粒子。
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