Minimap2：通用的基因组与剪接核苷酸序列比对工具
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简介：
Minimap2是一款高效且功能强大的软件工具，适用于基因组和剪接核苷酸序列的比对。它支持多种输入格式并提供精确的结果，是生物信息学研究中的重要资源。
入门使用Git克隆Minimap2：
```bash
git clone https://github.com/lh3/minimap2
cd minimap2 && make
```
对于长序列与参考基因组的比对，可以运行以下命令：
```bash
minimap2 -a testMT-human.fa testMT-orang.fa > test.sam
```
创建索引后再进行映射的方法如下：
```bash
minimap2 -x map-ont -d MT-human-ont.mmi testMT-human.fa
minimap2 -a MT-human-ont.mmi testMT-orang.fa > test.sam
```
使用预设参数时（此处未提供测试数据）:
```bash
minimap2 -ax map-pb ref.fa pacbio.fq.gz > aln.
```
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