
SIMER:用于生命科学和育种的数据模拟工具
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简介:
SIMER是一款专为生命科学研究及作物、动物育种领域设计的数据模拟软件工具。它能够高效地生成大规模遗传数据,支持研究人员进行假设检验与预测分析,加速创新研究进程。
西蒙生命科学与育种的数据模拟作者设计并维护了该工具。撰稿人包括唐振双、徐静亚、李新云、朱梦津、袁晓慧和赵树红,欢迎提出问题、建议或错误报告。
内容安装:
我们强烈推荐在Microsoft R Open上安装SIMER。
可以使用以下命令从GitHub安装最新版本的开发版:
```R
# 安装devtools包(如果尚未安装)
install.packages(devtools)
# 使用devtools从github下载并安装simer程序包
devtools::install_github(xiaolei-lab/SIMER)
```
成功安装后,可以通过键入以下命令加载SIMER:
```R
library(simer)
```
输入`?simer`可以获取所有参数的详细信息。
资料准备:
基因型数据应为数字格式(m行和2n列,其中m代表SNP数量,n代表个体数量)。如果您的原始数据是PLINK二进制格式、VCF或单体型文件,请先将其转换成上述所需格式。
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