
食饵捕食模型的MATLAB代码-推断社区组装过程: Inferring_community_assembly_processes
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简介:
本项目通过编写MATLAB代码实现食饵捕食模型,用于模拟和分析生物群落中物种间的相互作用,并推断自然生态系统中的社区组装过程。
食饵捕食模型的MATLAB代码实现基于《生态学与进化论方法》论文中的动态生态进化模型及近似贝叶斯计算(ABC)技术,用于从宏观模式推断社区组装过程。此代码在MATLAB R2017b版本中编写,并且每个m文件都包含详细的注释。
为了运行该模型,请执行名为“main_ecoevo.m”的主函数。这个脚本会启动默认的模型参数和初始条件(第25-69行),也可以将这些参数作为功能输入进行更改。在不同的建模场景中,设置适当的初始化至关重要。
生境变量定义了栖息地的数量及其资源/特征空间的位置;竞争变量则决定了竞争种群的数量、位置以及它们的生态位宽度、扩散倾向和可进化性等特性;捕食者变量同样描述了捕食者的数量与分布情况。这种灵活性允许我们根据需要运行多种模型方案,例如简化为一个栖息地中仅包含捕食者或捕食者-猎物自适应辐射的情况。
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