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基于Unet的深度学习在BraTS数据集上的2D脑肿瘤图像分割实践(四类分类)

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简介:
本文详细介绍了一种基于Unet架构的深度学习方法,在BraTS数据集中进行二维脑肿瘤图像的精确分割,实现对肿瘤四种类别的有效区分和识别。 本项目是一个基于Unet的多尺度分割实战项目,包含了数据集、代码以及训练好的权重文件,并且经过测试可以直接使用。 **项目介绍:** 总大小为271MB。 该项目的数据集是BraTS 3D脑肿瘤图像切分而成的2D图片分割任务。在仅进行10个epoch的训练后,全局像素点准确度达到了0.97,miou(平均交并比)为0.53。进一步增加训练轮数可以提升性能。 **代码介绍:** - **【训练】** train脚本会自动执行,并且会在设定尺寸的0.5到1.5倍之间随机缩放数据以实现多尺度训练。此外,utils中的compute_gray函数将mask灰度值保存在txt文件中,并为UNET网络定义输出通道。 - **【介绍】** 学习率采用余弦衰减策略,在run_results文件夹内可以查看训练集和测试集的损失及iou曲线(由matplotlib库绘制)。此外,还保存了训练日志、最佳权重等信息。在训练日志中可以看到每个类别的miou、召回率、精确度以及全局像素点准确率。 - **【推理】** 将待预测图像放置于inference文件夹下,并直接运行predict脚本即可进行推理操作,无需设定额外参数。 具体使用方法请参考README文档。即使是初学者也可以轻松上手此项目。

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客服
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  • UnetBraTS2D
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    本文详细介绍了一种基于Unet架构的深度学习方法,在BraTS数据集中进行二维脑肿瘤图像的精确分割,实现对肿瘤四种类别的有效区分和识别。 本项目是一个基于Unet的多尺度分割实战项目,包含了数据集、代码以及训练好的权重文件,并且经过测试可以直接使用。 **项目介绍:** 总大小为271MB。 该项目的数据集是BraTS 3D脑肿瘤图像切分而成的2D图片分割任务。在仅进行10个epoch的训练后,全局像素点准确度达到了0.97,miou(平均交并比)为0.53。进一步增加训练轮数可以提升性能。 **代码介绍:** - **【训练】** train脚本会自动执行,并且会在设定尺寸的0.5到1.5倍之间随机缩放数据以实现多尺度训练。此外,utils中的compute_gray函数将mask灰度值保存在txt文件中,并为UNET网络定义输出通道。 - **【介绍】** 学习率采用余弦衰减策略,在run_results文件夹内可以查看训练集和测试集的损失及iou曲线(由matplotlib库绘制)。此外,还保存了训练日志、最佳权重等信息。在训练日志中可以看到每个类别的miou、召回率、精确度以及全局像素点准确率。 - **【推理】** 将待预测图像放置于inference文件夹下,并直接运行predict脚本即可进行推理操作,无需设定额外参数。 具体使用方法请参考README文档。即使是初学者也可以轻松上手此项目。
  • Swin-Transformer和Unet自适应多尺训练与多:针对BraTS 3D2D项目
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    本项目采用Swin-Transformer结合Unet架构,创新性地引入了自适应多尺度训练策略,专为BraTS数据库中的3D脑肿瘤图像进行高效的2D切片级多类别分割。 项目介绍:总大小357MB 此项目基于Swin-Transformer和Unet架构,并结合自适应多尺度训练技术进行脑肿瘤的4类别分割任务。经过10个epochs的训练,全局像素点准确度已达到0.97。如果进一步增加训练轮数(epoch),其性能预计会更加优越。 代码介绍: 【训练】train脚本自动执行模型训练过程,并通过随机缩放数据至设定尺寸的0.5到1.5倍之间实现多尺度训练,以适应不同大小的数据输入。此外,在utils中的compute_gray函数负责将mask灰度值保存在txt文件中并定义网络输出通道数量。 【介绍】学习率采用余弦退火策略调整,并且损失和IOU曲线可以在run_results文件夹内查看。这些数据由matplotlib库绘制,训练日志、最佳模型权重等信息同样被妥善保存下来,在训练日志中可以找到每个类别的iou值、召回率、精确度以及全局像素点准确率。 【推理】将待预测的图像放置于inference目录下,并直接运行predict脚本即可完成推理过程,无需额外设置参数。 具体使用方法请参考README文件。该项目设计简单易用,即使是初学者也能轻松上手操作。
  • MRI影
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    本数据集包含多模态MRI影像与对应的临床信息,旨在辅助科研人员进行脑肿瘤自动分类研究,促进医学影像分析领域的发展。 基于MRI图像的脑肿瘤分类数据集包含7678张图片。
  • .zip
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    本数据集包含大量标注清晰的脑肿瘤图像,适用于深度学习模型进行实例分割研究和训练。 脑肿瘤图像数据集:实例分割.zip 是一个专门针对计算机视觉领域的实例分割任务的数据集。实例分割是识别并区分同一类别中的每个单独对象的技术,在医疗影像分析中用于定位病灶,如脑肿瘤。 该数据集中包含了一系列MRI或CT扫描图像,用于训练和测试机器学习模型以自动检测和分割脑肿瘤。预览内容需联系作者获取详细信息,这些原始数据集的使用可能受到隐私保护协议限制。 计算机视觉数据集强调了这个数据集的核心应用领域,即利用计算机处理和理解医疗影像中的视觉信息,并特别聚焦于实例分割任务。 压缩包内的文件名称列表及其作用如下: 1. README.txt:包含关于数据集的详细说明,包括来源、格式、使用方法及注意事项等。 2. ignore.txt:列出了一些不应被模型考虑或者在数据处理过程中应忽略的文件或目录。 3. data.yaml:配置文件,可能包含了关于数据集元信息的内容,如类别定义和预处理参数等。 4. train:包含用于训练模型的图像数据,并且这些图像已经标注了肿瘤的位置和形状。 5. valid:验证集,在模型训练过程中评估性能、防止过拟合及调整参数时使用。 6. test:测试集,在开发完成后用来最终评估模型在新数据上的泛化能力。 这个数据集提供了一个平台,用于训练和评估实例分割模型,特别是在脑肿瘤检测领域。开发者可以利用此数据集来训练深度学习模型(如Mask R-CNN)以实现对脑肿瘤的精确识别与分割,这对医疗诊断和治疗规划具有重要意义。同时,该数据集鼓励研究者在医疗图像分析领域的创新工作,并推动AI技术在医学健康行业的应用发展。
  • UNet完整代码
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    本项目提供一个基于UNet架构的深度学习模型,用于自动分割脑部MRI图像中的肿瘤区域。包括数据预处理、网络训练及结果评估等全套代码。 标题中的U-net脑肿瘤分割完整代码指的是一个基于U-Net网络的深度学习项目,用于自动识别并分割脑部MRI或CT扫描图像上的肿瘤区域。U-Net是一种由Ronneberger等人在2015年提出的卷积神经网络(CNN)架构,在生物医学图像分析中表现出色,特别是在处理小目标和定位方面具有优势。 该项目的数据集包含多种类型的脑部影像数据,并且每张图像是经过标注的,标明了肿瘤的具体位置及其边界。这些数据被用于训练与验证模型,以确保其能够准确地识别并分割出肿瘤区域。“网络”指的是U-Net架构本身,它由一个下采样路径和与其对称的上采样路径组成。前者负责获取图像的整体上下文信息,后者则通过结合下采样的特征图来实现精确到像素级的目标分类。 “训练”的过程是将数据集输入至模型中,并利用反向传播算法以及优化器(如Adam或SGD)调整网络权重以减少预测结果与实际标注之间的误差。在完成训练后,“测试”环节会使用未参与训练的数据评估模型的性能,常用指标包括Dice相似系数和IoU等。 “只跑了20个epoch”的表述意味着整个数据集被输入到神经网络中进行了二十次迭代处理。通常情况下,更多的迭代次数可以提高模型的表现力,但过度拟合的问题也需要引起注意——即当训练时间过长时,可能会导致模型对新样本的泛化能力下降。 标签“软件/插件”暗示了项目可能涉及特定图像处理、数据预处理或模型训练工具和库的支持。例如Python中的TensorFlow、Keras或者PyTorch框架,以及用于操作医学影像文件的OpenCV与Numpy等开源库。 在压缩包中,“Unet”可能是包含了该项目源代码、数据集配置文件及其他相关资源的目录名称之一。用户需要先解压这些内容,并按照指南运行项目以复现实验结果和研究模型性能表现。 综上所述,该深度学习项目展示了U-Net网络架构如何应用于脑肿瘤分割任务的具体实践案例,通过训练与测试过程让模型学会从医学影像中识别并预测出潜在的病灶区域。对于有兴趣深入理解此类技术原理及应用的研究者而言,该项目提供了一个很好的研究起点和参考框架。
  • MRI应用研究综述.pdf
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    本文为一篇研究综述,系统回顾了深度学习技术在磁共振成像(MRI)中进行脑肿瘤图像自动分割的应用进展与挑战。通过分析现有方法的优势和局限性,旨在推动该领域的进一步发展。 在医学影像处理领域,脑肿瘤的自动分割技术是研究的核心内容之一,尤其是在磁共振成像(MRI)技术中的应用极为重要。由于MRI具有非侵入性和清晰的软组织对比度,使其成为诊断脑瘤的重要工具。通过有效的图像分割技术可以实现早期诊断、提高患者存活率和治疗效果。 传统的手动分割方法依赖于医生的经验,耗时且存在个体差异,因此开发自动化的分割方法显得尤为必要。近年来深度学习尤其是卷积神经网络(CNN)在目标识别及生物医学影像处理方面表现突出,在脑肿瘤图像的自动化分割上也取得了重要进展。这类技术能够有效处理大规模的数据集,并为临床应用提供了新的解决方案。 研究中常用的MRI数据集包括BraTS,它提供高分级胶质瘤和低级别胶质瘤的多模态MRI数据及真实分割结果;XNAT数据库则包含了关于脑肿瘤患者的详细信息,如影像资料、大小位置等。这些资源对于开发和验证新的算法至关重要。 根据处理方式的不同,可以将现有的脑肿瘤图像分割方法分为手动、半自动以及全自动三大类。其中,深度学习技术在实现自动化方面扮演了关键角色:通过训练神经网络模型来识别并分离出目标区域,例如全卷积网络(FCN)、Unet及ResNet等结构都展示了出色的应用潜力。 尽管取得了显著进展,但现有的分割结果与实际对比时的匹配度仍有改进空间。未来的研究需要进一步优化模型架构、损失函数设计和训练策略以提高准确性。随着这些技术的进步和完善,深度学习在脑肿瘤影像处理中的应用将更加成熟可靠,并为临床实践提供更有效的支持。 此外,在传统文化中也有相关养生知识提及五脏与音乐的关联作用——如肝主木气,可通过特定曲目的演奏来平衡和调节体内能量状态。例如,《胡笳十八拍》因其包含克制木性及滋养水性的音符组合而被推荐给肝火旺盛的人群使用,并建议在阴气较重的时间段内聆听以达到调养效果。 总之,脑肿瘤图像分割技术是医学影像处理中的关键任务之一,随着深度学习尤其是卷积神经网络的应用发展,MRI脑瘤图像的自动识别与区分正在变得更加精确和高效。这将为早期诊断及治疗方案的选择提供强有力的技术支持,并有望在未来继续改进以达到更高的准确性水平。
  • 肝脏战(一).pdf
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    本PDF教程详解了利用深度学习技术进行肝脏肿瘤自动分割的方法和实践步骤,适合医学影像分析领域的初学者参考。 基于深度学习的肝脏肿瘤分割 实战(一).pdf 这篇文章详细介绍了如何利用深度学习技术进行肝脏肿瘤的自动分割。通过结合医学影像数据与先进的神经网络模型,该文档为研究人员及医疗工作者提供了一套完整的解决方案和技术指导,帮助他们更准确地识别和定位肝脏中的异常区域。