HH-Suite：远程蛋白质同源性检测工具包

简介：
HH-Suite是一款先进的在线软件工具包，专门用于进行高效、准确的远程蛋白质序列比对和同源性检测。它基于隐马尔可夫模型（HMM）技术，能够识别高度保守或低相似度的蛋白质家族成员。该平台为生物信息学研究提供了强大的资源支持，有助于深入理解蛋白质结构与功能的关系。 HH-suite3用于敏感序列搜索（C）约翰内斯·索丁，马库斯·迈耶，马丁·斯坦纳格，米洛·米尔迪塔，迈克尔·雷默特，安德里亚斯·豪瑟，安德里亚斯·比格特。HH-suite是一个开源软件包，用于基于隐马尔可夫模型（HMM）的成对比对进行敏感蛋白质序列搜索。 我们提供了一份详尽的文档资料，其中包含许多用法示例、常见问题解答和构建自己的数据库指南。安装可以通过下载静态编译版本或按照特定说明完成来实现。HH-suite3需要64位系统（可通过执行`uname -a | grep x86_64`检查）。在AMD/Intel CPU上，至少需支持SSE2指令集（通过执行Linux命令 `cat /proc/cpuinfo | grep sse2` 或 macOS 命令 `sysctl -a | grep machdep.cpu.features | grep SSE2` 进行检查）。 与SSE2相比，AVX2的运行速度大约快两倍。HH-suite3还可以在具有ARM64和PPC64LE CPU 的Linux系统上使用，并且可以在所有受支持系统的预编译二进制文件中找到。