基于区域生长算法的图像分割MATLAB代码-MT3DEPI: MT3DEPI

简介：
MT3DEPI是一款基于MATLAB开发的工具，采用区域生长算法进行图像分割。它能够高效准确地识别和分离不同区域，适用于多种图像处理任务。 基于区域生长法的图像分割MATLAB代码被用于论文《磁化传递加权EPI有助于原生fMRI空间中皮层深度的确定》中的研究工作。这项研究采用了公开可用的软件包，包括AFNI、SPM、ANTs、FreeSurfer和LAYNII。 以下是两个关键脚本的具体描述： （1）用于将原始时间序列分为偶数帧（CTRL，可以视为BOLD信号）和奇数帧（在功能运行中为DANTE准备的图像，在解剖运行中为MT准备的），并创建蒙版以进行运动校正。该脚本读取所有数据运行中的nifti格式图像，并使用bash shell编写。它依赖于AFNI程序，已在版本19.3.13中测试过。执行时间约为几分钟。 （2）用于对功能和解剖运行的数据进行运动校正的MATLAB脚本：该脚本读取所有功能和解剖数据运行，并将mc_job.m中的输入替换为这些nifti文件名，以实现更精确的图像校准处理过程。