
RA码MATLAB译码代码-NS-V-BM-Decoding:对比Neurosynth与BrainMap功能解码的项目代码
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简介:
本项目提供了一套基于MATLAB的RA码译码工具,用于比较Neurosynth和BrainMap在神经影像学中的功能解码效果。
为了在2018年INCF的Neuroinformatics会议上展示的一篇海报重现分析所需的全部代码,题为“比较词典和功能解码结果”,需要以下内容。
安装:
无需特别安装过程。Python代码是在版本2.7.13中编写的,因为作者坚持使用这个版本而不愿更新到Python 3。要重新创建Python分析和数字,需要numpy、pandas、scipy、seaborn以及neurosynth库的支持。
遗憾的是,要重现BrainMap风格的功能解码,则必须依赖于MATLAB。
用法:
每个数据库中的所有术语比较文件都位于terms目录下;执行BrainMap功能解码所需的脚本则在brainmap目录中;而用于Neurosynth功能解码的脚本则放置在neurosynth目录里。
两种方法所使用的输入都是二进制区域网络掩模的nifti格式文件,输出则是详细描述相关特征权重的一系列文档。
神经合成器解码:
- ns-get-dataset.ipynb
- ns-decoding.ipynb
脑图解码:
- BMA_ImageSearch.m
- BMA_ForR
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