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PM_DICOT基因组的MAKER2注释: 四个基因组的研究

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简介:
本研究采用MAKER2工具对四个不同PM_DICOT植物基因组进行深入注释分析,旨在揭示这些物种独特的遗传信息与进化关系。 MAKER2_PM_genome_annotation 使用 MAKER2 对四个 DICOT PM 基因组参考进行注释的软件与数据: **软件先决条件:** - RepeatModeler(版本 1.0.4),包括所有依赖项,如 NCBI BLAST。 - RepeatMasker(版本 4.0.5)和 RepBase(使用的是2015年8月7日版)。 - MAKER 版本 2.31.9 或其他任何版本 2 发行版均可。 - Augustus 版本 3.3 - BUSCO 版本 3 - SNAP - BEDtools(版本为2.24.0) **原始数据/资源:** 1. 基因组支架文件: - > Genome.fa: 使用 CLCbio 从头组装的参考基因组。 - 脱氨修饰 = 是 - 脱氨限制 = 2 - 质量修剪 = 是 - 质量限

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