
简单的分子动力学程序可以模拟粒子与Lennard-Jones势能之间的相互作用。
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简介:
分子动力学计划中的简易分子动力学程序能够模拟粒子间的Lennard-Jones势能相互作用。该程序编译符合Fortran 2008标准,以便支持`execute_command_line`函数的调用,从而实现创建输出目录的功能。这段代码是在2016年我的研究生硕士课程期间编写的,可能并不完全符合最新的Fortran标准。代码概述了获取粒子的初始坐标以及其他必要的参数,这些参数初始化了整个主程序所需的所有变量,例如循环计数器、求和变量和物理属性变量。计算的主循环负责更新粒子的位置和速度。在计算力之后,Velocity Verlet算法利用这些力来更新粒子的位置和速度。最后,程序会输出感兴趣的数据,例如更新后的坐标,这些数据可以被另一个程序用于可视化呈现。
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