
颜色分类LeetCode-DeepCC:一个新的基于深度学习的癌症分子亚型分类系统框架
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简介:
颜色分类LeetCode-DeepCC是一款创新的癌症分子亚型分类工具,采用深度学习技术,旨在提高癌症分型的准确性和效率,为个性化治疗提供有力支持。
颜色分类leetcode
DeepCC:一种新的基于深度学习的癌症分子亚型分类框架
更新:
添加了对使用keras框架进行深度学习的支持。
修改了深度网络架构以获得更好的性能。
依赖关系:
当前版本的DeepCC依赖于keras框架,支持CPU和GPU。请先按照说明安装在R中,并确保keras能够正确运行。
安装:
您可以使用devtools直接从GitHub安装DeepCC。
install.packages(devtools)
devtools::install_github(CityUHK-CompBio/DeepCC)
或者
install.packages(remotes)
remotes::install_github(CityUHK-CompBio/DeepCC)
快速开始:
作为案例研究,您可以获取CRCSC存储库中的组织良好的结直肠癌数据。
启动DeepCC只需要两个输入即可。
一个包含基因表达谱的数据框(每一行代表一个患者样本,列名应该是基因的Entrez标识符)
另一个是包含训练标签的字符向量。
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