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VesselSeg-Pytorch:用于视网膜血管分割的Pytorch工具包

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简介:
简介:VesselSeg-Pytorch是一款基于Pytorch开发的视网膜血管分割工具包,旨在提供高效、准确的视网膜血管自动识别解决方案。 VesselSeg-Pytorch:基于pytorch的视网膜血管分割工具包 介绍: 该项目是使用Python和PyTorch框架开发的视网膜血管分割代码库,包含数据预处理、模型训练与测试及可视化等功能模块。适用于从事视网膜血管分割研究的研究人员。 要求: 项目的python环境所需的主要软件包及其版本如下所示: - python:3.7.9 - pytorch:1.7.0 - torchvision:0.8.0 - cudatoolkit:10.2.89 - cudnn:7.6.5

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  • VesselSeg-PytorchPytorch
    优质
    简介:VesselSeg-Pytorch是一款基于Pytorch开发的视网膜血管分割工具包,旨在提供高效、准确的视网膜血管自动识别解决方案。 VesselSeg-Pytorch:基于pytorch的视网膜血管分割工具包 介绍: 该项目是使用Python和PyTorch框架开发的视网膜血管分割代码库,包含数据预处理、模型训练与测试及可视化等功能模块。适用于从事视网膜血管分割研究的研究人员。 要求: 项目的python环境所需的主要软件包及其版本如下所示: - python:3.7.9 - pytorch:1.7.0 - torchvision:0.8.0 - cudatoolkit:10.2.89 - cudnn:7.6.5
  • U-NetPytorch实现)
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    本项目采用Pytorch框架实现了基于U-Net的深度学习模型,专为视网膜血管自动分割设计,旨在提高眼底疾病诊断的准确性和效率。 代码适配数据集需要根据数据集的特点进行相应的调整和优化,确保程序能够高效准确地处理数据。这通常包括对算法的选择、参数的调优以及可能的数据预处理步骤等。在开始编码之前,深入理解数据集的需求和限制是至关重要的。
  • Vessel-WGAN-PyTorch: 采生成对抗络进行研究
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    简介:Vessel-WGAN-PyTorch项目利用生成对抗网络(WGAN)技术,在PyTorch框架下实现对视网膜血管图像的精确分割,推动了医学影像分析领域的进步。 船-维根-火炬 作者:谷玉超 该代码是使用Pytorch实现的。概述数据可以从服务器下载火车和测试数据。您也可以在eyedata文件夹中找到这些数据。 前处理: 该数据集包含20个训练图像,我的预处理的第一步是对它们进行随机裁剪至512 * 512大小。 第二步是随机调整火车图像的亮度、对比度以及色相。 我在代码中实现了此方法,因此可以方便地使用它。此外,基于GAN(生成对抗网络)的方法生成视网膜图像可以用作额外的数据源。 模型训练: 通过运行python train.py进行操作 依存关系 该代码依赖于以下库:Python 3.6 火炬皮尔结构体 vessel gan│├── eyedata # drive data│ ├── gycutils # 我的用于数据增强的工具包│ ├── Criterion.p
  • UNet代码
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    本项目提供了一种基于UNet架构的深度学习模型,用于自动分割视网膜图像中的血管结构。该代码旨在辅助医学研究与临床诊断,提高视网膜疾病的检测效率和准确性。 UNet医学影像分割源码的文件结构如下: - src:包含搭建U-Net模型的相关代码。 - train_utils:包括训练、验证以及多GPU训练所需的模块。 - my_dataset.py:自定义数据集类,用于读取DRIVE数据集(视网膜血管分割)。 - train.py:以单个GPU为例的训练脚本示例。 - train_multi_GPU.py:专为使用多个GPU进行训练而设计的脚本。 - predict.py:简易预测脚本,利用已训练好的权重文件对新图像进行预测测试。 - compute_mean_std.py:统计数据集各通道均值和标准差。
  • Pytorch-Segmentation-Multi-Models_NestedUNet_图像
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    本项目基于PyTorch开发,实现多种图像分割模型,重点展示了Nested UNet架构在处理复杂医学影像(如血管)任务中的优越性能。 Pytorch实现了基于多模型的眼底血管语义分割。所使用的模型包括:Deeplabv3、Deeplabv3+、PSPNet、UNet、UNet autoencoder、UNet nested、R2AttUNet、Attention UNet、Recurrent UNet、SEGNet、CENet、dsenseasp、RefineNet和RDFNet。
  • 图像与眼底三维重建
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    本研究致力于开发先进的算法和技术,用于精确分割视网膜血管图像,并构建眼底血管的三维模型,以提高眼科疾病的诊断和治疗水平。 眼底视网膜图像中的血管分布情况为高血压、糖尿病等疾病的早期诊断提供了重要的参考依据。通过计算机处理这些眼底图像可以减轻医生的重复劳动负担。本段落提出了一种新的用于分割眼底视网膜血管图像的算法,该算法首先利用局部归一化方法来消除背景差异性的影响;然后使用期望最大化算法进行聚类操作以实现精确地分割出血管区域;最后基于眼底成像原理通过投影逆变换构建了三维模型,使得可以从多个角度观察和分析视网膜结构。所建立的这种模型有助于更全面深入地理解与研究相关疾病的情况。
  • 自动病变图像中
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    本研究提出了一种创新算法,专门用于自动识别并分割病变视网膜图像中的复杂血管网络。通过优化现有技术,我们的方法能够更精确地捕捉细微血管结构,为早期诊断和治疗眼科疾病提供关键支持,尤其在糖尿病性视网膜病变等病症的评估中展现巨大潜力。 现有的视网膜血管分割方法大多只适用于正常视网膜图像的处理,并不能有效应对病变情况下的图像分割问题。为此,提出了一种新的针对病变视网膜图像进行血管网络分割的方法。 该方法首先利用向量场散度技术来确定大部分血管在病变视网膜中的中心线位置;接下来计算出这些中心线上每个像素的方向信息,并通过改进的定向局部对比度算法识别出位于中心线两侧的血管区域。最后,采用反向外推追踪策略处理获得的血管段末端部分,从而完整地分割出整个血管网络。 实验结果表明,在使用通用STARE眼底图像库中的所有病变视网膜图像进行测试时,该方法取得了0.9426的ROC曲线面积和0.9502的准确率。相比Hoover算法及Benson等人提出的方案,本段落提出的方法在性能上有了明显的提升,并且克服了后者对不同种类病变图像处理上的局限性问题,展现出良好的鲁棒性。
  • 改良U-Net图像算法
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    本研究提出了一种改进的U-Net架构,专门用于视网膜血管图像的精确分割。通过优化卷积神经网络结构和引入注意力机制,显著提升了血管边缘检测的准确性和稳定性,为眼科疾病的早期诊断提供了有力工具。 为了应对视网膜图像血管细小导致的分割精度低等问题,本段落在U-Net网络基础上引入了Inception、空洞卷积与注意力机制模块,提出了一种改进的视网膜血管图像分割算法。具体而言,首先,在编码阶段加入了Inception模块,并利用不同尺度的卷积核进行特征提取,以获得多尺度的信息;其次,在U-Net底部增加了级联空洞卷积模块,从而在不增加网络参数的情况下扩大了感受野;最后,在解码阶段结合注意力机制和跳跃连接方式设计反卷积操作,聚焦目标特征,解决了权重分散等问题。实验结果显示,基于DRIVE标准图像集的测试表明,该算法相较于U-Net和其他传统分割方法分别提高了1.15%、6.15%与0.67%的平均准确率、灵敏度和特异性。
  • Python卷积神经络在
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    本研究采用Python编程语言开发卷积神经网络模型,专门用于视网膜图像中血管结构的精确分割和识别,以提高眼科疾病的早期诊断效率。 该存储库包含使用卷积神经网络(U-net)对视网膜眼底图像中的血管进行分割的实现方法。这是一个二进制分类任务:预测眼底图像中每个像素是否为血管。所用的神经网络结构基于U-Net架构,并在DRIVE数据库上进行了性能测试。
  • LWNet:领先及简约模型
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    LWNet是一种先进的深度学习模型,专为视网膜血管精确分割而设计。它不仅提高了医学图像分析的效率和准确性,还通过优化架构实现了轻量化,便于在资源受限环境下应用。 您可以访问我们使用简约模型进行视网膜血管分割工作的官方存储库。上图展示了一个 WNet 架构,它包含大约 7 万个参数,并且在性能上接近或优于其他更复杂的技术。有关更多详细信息,请查阅相关论文:《The Little W-Net That Could: State-of-the-Art Retinal Vessel Segmentation with Minimalistic Models》(Adrian Galdran, André Anjos, Jose Dolz, Hadi Chakor, Hervé Lombaert, Ismail Ben Ayed)。如果您使用我们的工作并发现它对您有所帮助,我们非常感谢您的引用。