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3D-NII-VISUALIZER:基于VTK和Qt5的NIfTI(nii.gz)文件3D可视化工具

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简介:
3D-NII-VISUALIZER是一款集成了VTK和Qt5技术的高效软件,专为NIfTI格式医学影像(nii.gz)提供三维可视化服务。 使用VTK和Qt5的NIfTI(nii.gz)3D可视化工具可通过Python在虚拟环境中运行创建。Mac用户可以选用virtualenv或conda来建立环境;Windows用户则必须使用conda。安装所需依赖项,如PyQt5、vtk及sip,可以通过pip命令执行:`pip install PyQt5 vtk sip`。 启动程序时,请输入如下指令: ``` python ./visualizer/brain_tumor_3d.py -i ./sample_data/10labels_example/T1CE.nii.gz -m ./sample_data/10labels_example/mask.nii.gz ``` 生成PyInstaller二进制文件,需要根据您的项目目录调整.spec文件中的路径: - 对于Mac用户:使用`pyinstaller Theia_Mac.spec` - Windows用户则应执行:`pyinstaller Theia_Windows.spec`

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  • 3D-NII-VISUALIZERVTKQt5NIfTInii.gz3D
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    3D-NII-VISUALIZER是一款集成了VTK和Qt5技术的高效软件,专为NIfTI格式医学影像(nii.gz)提供三维可视化服务。 使用VTK和Qt5的NIfTI(nii.gz)3D可视化工具可通过Python在虚拟环境中运行创建。Mac用户可以选用virtualenv或conda来建立环境;Windows用户则必须使用conda。安装所需依赖项,如PyQt5、vtk及sip,可以通过pip命令执行:`pip install PyQt5 vtk sip`。 启动程序时,请输入如下指令: ``` python ./visualizer/brain_tumor_3d.py -i ./sample_data/10labels_example/T1CE.nii.gz -m ./sample_data/10labels_example/mask.nii.gz ``` 生成PyInstaller二进制文件,需要根据您的项目目录调整.spec文件中的路径: - 对于Mac用户:使用`pyinstaller Theia_Mac.spec` - Windows用户则应执行:`pyinstaller Theia_Windows.spec`
  • 使用fMRI将4D-nii转换为3D-nii
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    本工具箱采用fMRI技术,专门设计用于高效地将复杂的4D-nii格式医学影像数据转化为便于分析处理的3D-nii格式,极大地简化了神经科学研究中的数据准备流程。 使用fMRI将4D-nii文件转换为3D-nii文件的工具箱操作如下:第一步,下载该工具箱,并双击dcm2niigui.exe以打开页面;第二步,在输出格式(Output Format)中选择SPM8(3D NIFTI nii);第三步,将fMRI的4D-nii文件拖入已打开的工具箱即可完成转换。
  • MatlabNifti包以读取.nii格式
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    这是一个专为Matlab设计的Nifti工具包,旨在便捷地读取和处理.nii格式医学影像文件。该工具包简化了.nii文件的数据访问与分析流程。 在MATLAB中处理.nii格式的脑部MR图像可以通过NIfTI程序实现读取、显示和保存等功能。具体步骤如下: 1. 使用`load_nii_hdr(output.hdr)`函数加载头文件信息,获取结构体变量hdr、filetype、fileprefix以及machine。 2. 利用`load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine)`从头文件中读取图像数据,并将结果存储在img和hdr中。 3. 使用`save_nii(nii, filename, [old_RGB])`函数保存处理后的MRI图像。
  • 预编译VTKQt5库(VTK 9.0)
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    简介:本项目提供了一个集成VTK 9.0和Qt5的预编译可视化库,旨在简化三维图形应用开发流程,适用于科研、工程等领域的数据展示需求。 编译好的Vtk9.0三维可视化库(C++版本)与QT5绑定,可以直接使用,并且包含调试版和发布版的库文件。
  • Point Cloud Visualizer: Three.js点云前端
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    Point Cloud Visualizer是一款基于Three.js开发的点云数据前端可视化工具,旨在为用户提供直观、高效的3D点云浏览和分析体验。 点云可视化器是一款基于电子和threejs的前端工具,支持Ascii和二进制格式的.pcd文件。 当前功能包括: - 多个文件比较 - 以颜色标记每个数据点 - 提供图形用户界面调整颜色及数值设置 - 支持自由视角查看 - 显示信息面板 - 可视化显示点云强度 待办事项: - 增加对二进制压缩格式的.pcd文件支持 - 通过Apollo CNN分割可视化障碍物检测
  • C++编写音频:Audio-Visualizer
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  • Smiles-3D-Vue:Vue.jsSMILES3D渲染
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    Smiles-3D-Vue是一款利用Vue.js构建的强大工具,专注于从SMILES字符串生成分子结构的三维视图。它为化学家和研究人员提供了直观、便捷的方式来理解和分析复杂的分子结构。 适用于SMILES(简化的分子输入行输入系统)文件的3D渲染应用程序用于教育和示范目的。该程序接受并使用特定方法将SMILES字符串从文件转换为包含坐标的格式,并利用某个库来显示3D复合模型。在开发过程中,我发现这不是真正的JavaScript库也不是JQuery插件,由于时间限制无法将其重写为Vue.js组件,因此最终决定以Vue.js应用的形式进行构建。 主要功能包括: - 使用渐进式JavaScript框架。 - 提供演示与交互体验。 - 利用特定技术实现3D模型渲染。 - 有验证步骤来确保仅接受有效的SMILES文件输入。 - 在所有浏览器(包括移动设备)上表现良好,这得益于响应式的网页设计。 此外: - 支持同时转换和渲染多个文件的功能; - 具备拖放功能; - 使用SASS/SCSS进行样式设置,并且代码已经进行了彻底的注释。
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    Spectrum Vu Meter 3D Visualizer 是一个Unity资源包,提供高质量的频谱和音量表可视化效果,适用于音乐视觉化、游戏界面和其他音频相关项目。 Unity3D 最新版的 3D Visualizer Spectrum Vu Meter 1.6 提供了音频可视化功能,并内置多个参考场景。