
QPCRTools:用于分析qPCR数据的R软件包
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简介:
QPCRTools是一款专为处理和分析实时定量聚合酶链式反应(qPCR)数据设计的R语言软件包。它提供了丰富的工具来优化实验流程,帮助研究人员高效地解读基因表达变化。
qPCR工具R软件包可用于分析qPCR数据。安装方法如下:
```r
install.packages(devtools)
devtools::install_github(kevincjnixon/qPCRTools)
```
使用示例(ddCt方法):
```r
library(qPCRTools)
easyRT() # 交互式运行
# 或者不显示误差条或统计信息时的命令如下:
easyRT(showEB=F, showStat=F)
```
在交互模式下,程序会弹出文件浏览器以供选择要分析的文本分隔文件。如果输入的是bioRad格式的数据,则需要用户确认是Y/N(具体详情未提及)。此外,还需要设定一个标准偏差阈值来过滤Ct值:对于一式三份样本,若其SD超过该指定阈值,则会从数据集中移除异常高的离群点进行后续分析。
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