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EntropyHub:用于熵时间序列分析的开源工具包

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简介:
EntropyHub是一款专门针对熵时间序列进行高效分析与处理的开源软件工具包。它为科研人员提供了一系列强大的功能来研究复杂系统的动态特性。 EntropyHub是一个用于进行熵时间序列分析的开源工具包。它提供了一系列功能齐全的方法来计算基于时间序列数据的信息理论上的熵测量值,并且可以兼容MatLab、Python及Julia三种编程语言,同时在这些语言中保持一致简单的语法结构。 用户可以根据自己的需求通过命令行指定关键字参数来自定义各种熵方法的应用范围,从基础的样本熵到复杂的复合多尺度校正交叉条件熵都可轻松实现。目前EntropyHub包括了18个基本/核心熵函数、8种交叉熵函数以及3种二维熵功能,并且所有这些都可以利用时延嵌入进行状态空间重构。 此外,用户还可以使用每个基础和交叉熵方法的多种多尺度变体版本,如复合、精细及分层等不同类型的多尺度策略。EntropyHub的主要目标是简化复杂的测量过程并提高其可操作性。随着更多关于近似熵计算的方法被科学文献引入,这一工具包也在不断更新和完善中。

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  • EntropyHub
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    EntropyHub是一款专门针对熵时间序列进行高效分析与处理的开源软件工具包。它为科研人员提供了一系列强大的功能来研究复杂系统的动态特性。 EntropyHub是一个用于进行熵时间序列分析的开源工具包。它提供了一系列功能齐全的方法来计算基于时间序列数据的信息理论上的熵测量值,并且可以兼容MatLab、Python及Julia三种编程语言,同时在这些语言中保持一致简单的语法结构。 用户可以根据自己的需求通过命令行指定关键字参数来自定义各种熵方法的应用范围,从基础的样本熵到复杂的复合多尺度校正交叉条件熵都可轻松实现。目前EntropyHub包括了18个基本/核心熵函数、8种交叉熵函数以及3种二维熵功能,并且所有这些都可以利用时延嵌入进行状态空间重构。 此外,用户还可以使用每个基础和交叉熵方法的多种多尺度变体版本,如复合、精细及分层等不同类型的多尺度策略。EntropyHub的主要目标是简化复杂的测量过程并提高其可操作性。随着更多关于近似熵计算的方法被科学文献引入,这一工具包也在不断更新和完善中。
  • iGPS:GNSS位置互动-
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    iGPS是一款专为GNSS位置时间序列设计的交互式分析工具,旨在促进数据处理与研究。该软件免费开源,便于用户进行深入探索和自定义开发。 用交互式数据语言(IDL)编写的工具能够处理和分析每日连续的GPS位置时间序列。它可以读取多种格式的时间序列数据,检测异常值并消除异常观察范围,查找跳跃,并提取共模分量(CMC)等。
  • 复杂性与
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    《时间序列复杂性与熵分析》一书深入探讨了时间序列数据中的复杂模式和结构,并利用熵理论进行量化研究。该书结合了数学模型、统计学方法以及实际应用案例,为读者提供了对时间序列分析的全面理解,尤其侧重于复杂系统中的信息度量及预测能力提升。 时间序列的复杂度和熵可以帮助我们更好地理解复杂度和熵的概念。
  • PyTS:适Python
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    PyTS是一个专为时间序列分类设计的Python工具包,提供了一系列算法和数据集,旨在简化时间序列分析任务,助力研究人员与开发者高效处理时间序列数据。 Pyts是一个用于时间序列分类的Python软件包。它的目标是通过提供预处理工具、实用程序以及最新算法实现来简化时间序列分类的过程。这些算法通常涉及将原始的时间序列转换为另一种形式,因此pyts提供了多种方法来进行这种转换。 安装依赖关系: - Python(>=3.6) - NumPy(>=1.17.5) - SciPy(>=1.3.0) - Scikit-Learn(>=0.22.1) - Joblib(> = 0.12) - Numba(>=0.48.0) 为了运行示例,还需要安装Matplotlib (>=2.0.0)。 用户可以通过以下方式轻松安装pyts: 使用pip命令:`pip install pyts` 或者通过conda从conda-forge通道进行安装:`conda install -c conda-forge pyts` 此外,您还可以通过克隆存储库来获取最新版本的Pyts。
  • Python实现实-
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    本资源提供使用Python进行时间序列分析的实用教程及源代码,涵盖数据预处理、模型构建与评估等内容,适合数据分析爱好者和技术从业者学习参考。 我的教授推荐了一本关于时间序列分析的书给我阅读。昨天我读了这本书以及另一本书《》。两本书各有千秋,《前者》内容更先进一些,并提供了一些新颖的观点,而后者则是中级水平,包含了一些实际的例子,尽管这些例子有些简单化且效果一般。虽然它涵盖了很多主题并且交替使用R和Python语言进行介绍,但我个人偏好Python。我将继续用Python学习时间序列分析的相关知识。 然而,本课程主要使用R编程语言,并要求我在掌握并应用R的过程中进一步学习。不过我已经计划为这门课制作一份基于Python的注解版本来辅助理解与实践。 此外,《》这本书很少涉及最新的TS模型和方法(2017),因此在阅读时需要注意其内容可能不够前沿。 时间序列分析包括以下章节: - 第一章:不同类型的数据 - 横截面数据、时间序列数据及面板数据的介绍; - 时间序列内部结构,如总体趋势、季节性变动等; - 序列图与子系列剧情展示; - 多箱图和周期变化分析; - 第二章:了解时间序列数据 - 自相关性和部分自相关的概念; 以上便是对原文内容的重写。
  • MATLAB
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    MATLAB时间序列工具包提供了一系列强大的函数和应用程序,用于处理、分析和建模时间序列数据。 Matlab时间序列工具箱提供了一系列用于分析和建模时间序列数据的功能。这些功能可以帮助用户进行数据预处理、模型拟合、预测以及频域分析等操作。通过使用该工具箱,研究人员和工程师可以更有效地探索时间序列中的模式,并基于此做出准确的决策或预测。
  • TRENTOOL 3.3 - 传递与Matlab
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    TRENTOOL 3.3是一款专为时间序列分析设计的MATLAB工具箱,特别擅长于计算传递熵。它提供了一套全面的功能来研究复杂系统的因果关系和信息流。 传递熵的MATLAB工具包用于计算时间序列的传递熵。
  • Python-pyts:转换与
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    Pyts是专为时间序列数据设计的Python库,提供丰富的转换和分类方法,助力研究人员和开发者高效处理时间序列任务。 pyts是一个用于时间序列转换和分类的Python包。
  • 版混沌与预测箱.zip
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    本资源提供一款针对混沌时间序列进行分析和预测的开源工具箱,包含多种算法模型及可视化模块,适用于科研人员和技术爱好者深入研究复杂系统动态特性。 感谢陆老师提供了这个版本的开源资料。混沌时间序列分析与预测工具箱 Version3.0 包括以下功能: 1. 生成各种混沌时间序列: - Logistic 映射:\ChaosAttractors\Main_Logistic.m - Henon映射: \ChaosAttractors\Main_Henon.m - Lorenz 吸引子: \ChaosAttractors\Main_Lorenz.m - Duffing 吸引子: \ChaosAttractors\Main_Duffing.m - Duffing2 吸引子: \ChaosAttractors\Main_Duffing2.m - Rossler 吸引子: \ChaosAttractors\Main_Rossler.m - Chens 吸引子: \ChaosAttractors\Main_Chens.m - Ikeda 吸引子: \ChaosAttractors\Main_Ikeda.m - Mackey-Glass 序列: \ChaosAttractors\Main_MackeyGLass.m - Quadratic 序列: \ChaosAttractors\Main_Quadratic.m 2. 计算时延(delay time): - 自相关法:\DelayTime_Others\Main_AutoCorrelation.m - 平均位移法:\DelayTime_Others\Main_AverageDisplacement.m - 去偏的复自相关法: \DelayTime_Others\Main_ComplexAutoCorrelation.m - 互信息法: \DelayTime_MutualInformation\Main_Mutual_Information.m 3. 计算嵌入维(embedding dimension): - 假近邻法:\EmbeddingDimension_FNN\Main_FNN.m 4. 同时计算时延与嵌入窗(delay time & embedding window): - CC 方法: \C-C Method\Main_CC_Method_Luzhenbo.m - 改进的CC方法: \C-C Method Improved\Main_CC_Method_Improved.m 5. 计算关联维(correlation dimension): - GP 算法:\CorrelationDimension_GP\Main_CorrelationDimension_GP.m 6. 计算K熵(Kolmogorov Entropy): - GP算法: \KolmogorovEntropy_GP\Main_KolmogorovEntropy_GP.m - STB 算法: \KolmogorovEntropy_STB\Main_KolmogorovEntropy_STB.m 7. 计算最大Lyapunov指数(largest Lyapunov exponent): - 小数据量法:\LargestLyapunov_Rosenstein\Main_LargestLyapunov_Rosenstein1.m, \LargestLyapunov_Rosenstein\Main_LargestLyapunov_Rosenstein2.m 和 \LargestLyapunov_Rosenstein\Main_LargestLyapunov_Rosenstein3.m 8. 计算 Lyapunov指数谱(Lyapunov exponent spectrum): - BBA算法: \LyapunovSpectrum_BBA\Main_LyapunovSpectrum_BBA1.m 和 \LyapunovSpectrum_BBA\Main_LyapunovSpectrum_BBA2.m 9. 计算二进制图形的盒子维(box dimension)和广义维(genealized dimension): - 覆盖法: \BoxDimension_2D\Main_BoxDimension_2D.m 和 \GeneralizedDimension_2D\Main_GeneralizedDimension_2D.m 10. 计算时间序列的盒子维(box dimension)和广义维(genealized dimension): - 覆盖法: \BoxDimension_TS\Main_BoxDimension_TS.m 和 \GeneralizedDimension_TS\Main_GeneralizedDimension_TS.m 11. 混沌时间序列预测(chaotic time series prediction): - RBF神经网络一步预测和多步预测 - 一步预测: \Prediction_RBF\Main_RBF.m - 多步预测: \Prediction_RBF\Main_RBF_MultiStepPred.m - Volterra级数一步预测和多步预测: - 一步预测: \Prediction_Volterra\Main_Volterra.m - 多步预测: \Prediction_Volterra\Main_Volterra_MultiStepPred.m 12. 创建替代数据(Surrogate Data): - 随机相位法: \SurrogateData\Main_SurrogateData.m
  • MATLAB软件程
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    本软件为MATLAB环境下的时间序列分析工具,提供全面的数据处理与建模功能,助力用户深入研究和预测各类时间序列数据。 在 MATLAB 中进行时间序列分析是一项常见的任务,在金融、工程和社会科学等领域尤为常见。这涉及使用统计方法研究按时间顺序排列的数据集。MATLAB 提供了强大的工具和函数库来支持这类分析,本程序集合正是这样一个资源,包含了进行时间序列分析所需的常用源代码和详细的使用说明。 首先理解时间序列的基本概念:它是由一系列按照特定的时间间隔记录下来的数据点构成的。在 MATLAB 中,可以利用 `timeseries` 对象创建并操作这些数据集。 1. **数据导入**:可以通过 `readtable` 或 `csvread` 函数将外部文件(如 CSV 文件)中的数据读入到矩阵或表格中,并转换为 `timeseries` 格式。例如: ```matlab data = readtable(yourfile.csv); ts = timeseries(data.YourColumn, datenum(data.TimeColumn)); ``` 2. **数据预处理**:在进行分析之前,可能需要对时间序列执行平滑、差分或对齐等操作以准备它们。MATLAB 提供了 `movmean`(移动平均)、`diff` 和 `alignstart` 等函数来实现这些任务。 3. **描述性统计**:使用如 `summary` 或 `describe` 函数可以获取时间序列的基本统计数据,包括均值、标准偏差等信息。这有助于理解数据集的整体特征。 4. **趋势分析**:可以通过线性回归 (`polyfit`) 或非线性拟合(通过 `fit` 函数)来识别时间序列中的任何趋势模式,并使用 `detrend` 去除其中的直线部分。 5. **季节性和周期性**:利用 `seasonaldecompose` 分解时间序列,以区分其季节性、趋势和残差成分。此外,还可以通过频率域分析(例如用到 `periodogram` 和 `spectrogram`)来进一步探索数据中的周期模式。 6. **自相关与偏自相关分析**:使用 `autocorr` 生成自相关函数 (ACF) 图表,并借助 `parcorr` 来计算偏自相关函数(PACF),帮助确定模型的阶数和滞后结构,这对于建立 ARIMA 模型是关键步骤。 7. **ARIMA 模型**:利用 `arima` 函数来构建并估计非平稳时间序列的自回归积分滑动平均 (ARIMA) 模型。对于旧版本 MATLAB 用户来说,则可能使用到 `arimaest` 函数。 8. **状态空间模型**:借助于 `ssm`,可以创建和评估更复杂的时间序列动态过程的状态空间表示法。 9. **预测与模拟**:一旦建立了合适的时间序列模型(例如 ARIMA 或 SSM),便可通过调用如 `forecast` 和 `simulate` 函数来进行未来趋势的预测或对现有模型性能进行仿真测试。 10. **诊断分析**:使用 `residplot` 和 `acf` 对生成的数据残差图和自相关性图表进行检查,确保所建立的时间序列模型是有效的,并且没有显著偏差或者异常值存在。 11. **可视化**:MATLAB 提供了丰富的绘图工具(如 `plot`, `plotyy`, `plot3` 和专门用于展示时间序列数据的 `timeseriesplot`),使得结果易于理解和分享。通过学习和实践这些代码示例,可以更深入地掌握 MATLAB 中的时间序列分析技术。 请仔细阅读提供的说明文档以更好地理解如何应用这些工具和技术解决实际问题,并且不断探索新的方法将有助于你在该领域取得更大的进步。