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Pval_Adjust: 多个比较中的P值调整

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简介:
简介:Pval_Adjust方法用于统计分析中进行多重比较时调整P值,以控制错误发现率或家庭-wise误差率,提高推断结果的可靠性。 在统计分析过程中进行多个独立或相关的假设检验时,我们常常会遇到多重比较的问题。如果直接使用单一的显著性标准(如0.05),可能会增加假阳性的概率,即所谓的“多测试错误”。为了应对这一问题,需要对这些p值进行调整以控制这种误差。 `pval_adjust` 是一个在MATLAB和Octave环境中使用的工具,专门用来处理多重比较的问题。它提供了多种方法来校正p值,从而能够有效控制假发现率(False Discovery Rate, FDR)或确保家族错误率(Family-Wise Error Rate,FWER)。 1. **Bonferroni校正**:这是一种最保守的方法,适用于严格控制FWER的情形下。其基本思想是将初始的显著性水平α除以比较的数量,得到每个单独测试所需的p值阈值。例如,在进行5次独立检验且α=0.05的情况下,每次试验的临界p值将是 0.01。 2. **Sidak校正**:比Bonferroni稍微宽松一些,但同样考虑了多重比较的问题,并考虑到各测试间的关联性后提供调整后的p值。 3. **False Discovery Rate (FDR) 控制**:这是一种更灵活的方法,主要关注假阳性发现的比例。其中最常用的是Benjamini-Hochberg (BH) 算法。该算法对所有未校正的p值进行排序,并逐个接受那些小于或等于其秩乘以α/q(q是期望的最大FDR)的假设。 4. **其他方法**:`pval_adjust` 可能还包括其它校正方式,如Holm-Bonferroni、Hochberg、Hommel和Benjamini-Yekutieli等。这些方法在不同的程度上平衡了保守性和灵活性的需求。 使用MATLAB或Octave中的 `pval_adjust` 函数时,你需要提供原始的未调整过的 p 值向量,并选择适当的校正方式。该函数将返回经过调整后的p值向量,用于判断各个假设检验是否具有统计显著性意义。 在实际应用中,`pval_adjust` 经常被应用于基因表达数据分析、实验设计验证以及社会科学研究等领域,帮助研究者更准确地解读大量数据的比较结果,并避免由于多次测试而造成的偏差。

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  • Pval_Adjust: P
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    简介:Pval_Adjust方法用于统计分析中进行多重比较时调整P值,以控制错误发现率或家庭-wise误差率,提高推断结果的可靠性。 在统计分析过程中进行多个独立或相关的假设检验时,我们常常会遇到多重比较的问题。如果直接使用单一的显著性标准(如0.05),可能会增加假阳性的概率,即所谓的“多测试错误”。为了应对这一问题,需要对这些p值进行调整以控制这种误差。 `pval_adjust` 是一个在MATLAB和Octave环境中使用的工具,专门用来处理多重比较的问题。它提供了多种方法来校正p值,从而能够有效控制假发现率(False Discovery Rate, FDR)或确保家族错误率(Family-Wise Error Rate,FWER)。 1. **Bonferroni校正**:这是一种最保守的方法,适用于严格控制FWER的情形下。其基本思想是将初始的显著性水平α除以比较的数量,得到每个单独测试所需的p值阈值。例如,在进行5次独立检验且α=0.05的情况下,每次试验的临界p值将是 0.01。 2. **Sidak校正**:比Bonferroni稍微宽松一些,但同样考虑了多重比较的问题,并考虑到各测试间的关联性后提供调整后的p值。 3. **False Discovery Rate (FDR) 控制**:这是一种更灵活的方法,主要关注假阳性发现的比例。其中最常用的是Benjamini-Hochberg (BH) 算法。该算法对所有未校正的p值进行排序,并逐个接受那些小于或等于其秩乘以α/q(q是期望的最大FDR)的假设。 4. **其他方法**:`pval_adjust` 可能还包括其它校正方式,如Holm-Bonferroni、Hochberg、Hommel和Benjamini-Yekutieli等。这些方法在不同的程度上平衡了保守性和灵活性的需求。 使用MATLAB或Octave中的 `pval_adjust` 函数时,你需要提供原始的未调整过的 p 值向量,并选择适当的校正方式。该函数将返回经过调整后的p值向量,用于判断各个假设检验是否具有统计显著性意义。 在实际应用中,`pval_adjust` 经常被应用于基因表达数据分析、实验设计验证以及社会科学研究等领域,帮助研究者更准确地解读大量数据的比较结果,并避免由于多次测试而造成的偏差。
  • fakenmc/pval_adjust:针对进行p-MATLAB开发
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    pval_adjust是由MATLAB编写的工具箱,专门用于在统计分析中处理多重假设检验时对P值进行调整。此工具能够有效控制错误发现率或家庭-wise误差率,帮助研究人员准确解读大规模数据集中的显著性结果。 用于调整多重比较的 p 值的 MATLAB/Octave 函数。给定一组 p 值,返回使用以下几种方法之一调整后的 p 值:“holm”、“hochberg”、“hommel”、“bonferroni”、“BH”、“BY”、“fdr”、“sidak”或“无”。这是 R 语言中 p.adjust 函数的实现。与 R 函数不同,此函数不处理缺失值,并添加了一种额外的方法:“sidak”,如维基百科所述。如果您在研究中使用了该脚本,请引用以下论文:* Fachada N,罗莎 AC。(2018)。micompm:用于观察的多变量独立比较的 MATLAB/Octave 工具箱。
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