
Descriptastorus:用于化学机器学习的描述符计算及可选存储
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简介:
Descriptastorus是一款高效的工具,专门设计用于加速化学机器学习中的描述符计算,并提供灵活的数据存储选项,助力科研人员快速推进研究进程。
DescriptaStorus 提供快速随机访问功能,适合用于机器学习以及索引分子文件的场景。它提供了一种机制来为新分子生成新的描述符,并且验证了在不同的软件/硬件环境中可以重现相同的存储内容。此外,还包含一个简单的脚本,可以根据原始数据创建自己的描述符文件。
使用 DescriptaStorus 的基本方法有三种:
1. 使用脚本来制作 DescriptaStore。
2. 将新数据追加到现有的存储中。
3. 通过 DescriptaStore 访问属性。
要开始使用,您需要安装以下库:
- rdkit
- scikit-learn
可以通过如下命令进行安装:
```
pip install git+https://github.com/bp-kelley/descriptastorus.git
```
此外,请确保您的环境中已经安装了 kyotocabinet 库。Kyotocabinet 是读写 InChIKey 和名称索引所必需的。
在 setup.py 文件中可能会有其他要求,但实际需要的是 Python 2 / 3 环境和 R 软件包的支持。
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