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基于MATLAB的3D逆向扫描相干衍射图案(含相位恢复与层析重建)代码.zip

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简介:
该压缩包包含使用MATLAB编写的代码,用于实现三维逆向扫描相干衍射成像技术,包括相位恢复和层析重建功能。 1. 版本:MATLAB 2014/2019a/2021a 2. 提供案例数据,可以直接运行 MATLAB 程序。 3. 代码特点包括参数化编程、便于更改的参数设置、清晰易懂的编程思路和详细的注释说明。 4. 面向对象:适合计算机科学、电子信息工程及数学等专业的大学生用于课程设计、期末作业以及毕业设计项目。

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  • MATLAB3D.zip
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    该压缩包包含使用MATLAB编写的代码,用于实现三维逆向扫描相干衍射成像技术,包括相位恢复和层析重建功能。 1. 版本:MATLAB 2014/2019a/2021a 2. 提供案例数据,可以直接运行 MATLAB 程序。 3. 代码特点包括参数化编程、便于更改的参数设置、清晰易懂的编程思路和详细的注释说明。 4. 面向对象:适合计算机科学、电子信息工程及数学等专业的大学生用于课程设计、期末作业以及毕业设计项目。
  • MATLAB光学光谱分开发
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    本项目致力于使用MATLAB开发一套针对光学相干断层扫描(OCT)技术的图像重建及光谱数据分析工具。通过该套程序,能够有效处理OCT数据,进行精确的图像重构,并对获取的数据实施深入的光谱学分析,为生物医学研究和临床应用提供强有力的技术支持。 该代码用于光谱域光学相干断层扫描(OCT)图像的重建及光谱分析,并作为我们称为MOZART的OCT分子成像平台的一部分使用。此代码旨在读取Thorlabs OCT设备生成的原始干涉图,其中SW版本4的效果最佳,但也支持对一些特定变化进行处理的版本3数据。它能够将这些原始干涉图转换为2D、3D或散斑方差形式下的OCT图像,并提供额外的功能: - 计算归一化的散斑方差(用于血管检测) - 基于双波段光谱分析计算色散补偿 - 绘制光谱对比度图表 - 创建结合了OCT图像、光谱分析和散斑方差的综合图像 此外,该代码支持创建更多种类的图像及执行更复杂的分析。此代码被用于发表在《科学报告》2016年的论文“具有皮摩尔灵敏度的对比增强光学相干断层扫描,用于功能性体内成像”,作者包括O Liba、ED SoRelle、D Sen和A de La Zerda。 如果您使用了我们的代码,请引用上述提及的研究文献。
  • 检索中丢失像素缺失数据修-MATLAB开发
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    本项目利用MATLAB进行迭代相位检索,专注于解决丢失像素问题,通过重建衍射图案和修复缺失数据,提升图像质量与精度。 在光学成像领域,相位检索是一项关键技术,用于从衍射图案中恢复物体的原始信息。这项技术特别适用于存在丢失像素的情况下的迭代重建过程。 首先理解的是迭代相位检索的基本原理。当一束光经过一个物体时,其波前会受到物体相位的影响而发生改变,形成衍射图案。然而,这个衍射图案只包含了物体相位的信息,并不直接包含振幅信息。为了恢复原始的物体质地分布,科学家们开发了多种迭代算法如Gerchberg-Saxton、Kaczmarz和Fienup等方法来逐步逼近物体的真实相位分布。 本代码库特别关注于在有丢失像素的情况下的处理问题。实际应用中由于传感器故障或噪声等因素导致衍射图案中的某些数据无法获取,即存在丢失的像素点。这种情况下恢复这些缺失的数据是至关重要的,因为它们可能携带着关键的信息用于重建物体的真实相位分布。 MATLAB代码实现了一个迭代重建过程包括以下几个步骤: 1. 初始化:通常使用零值或随机数初始化相位分布。 2. 模拟衍射:基于当前的相位分布计算对应的衍射图案,并与实验测量的结果进行对比。 3. 更新相位:根据模拟和实际衍射图样的差异调整相位分布。这一步可能涉及各种优化策略,如梯度下降或最小二乘法等方法以提高精度。 4. 重复迭代:不断重复上述步骤直到达到一个稳定的解或者达到了事先设定的最大迭代次数。 在处理丢失像素时,代码可能会采用插值或其他恢复策略来估算这些缺失数据的值。选择合适的算法和参数设置将直接影响到重建质量和速度。 此外,“光学通信”期刊上的一篇文章提供了更深入的理论背景及实验验证结果,包括性能评估、不同方法之间的比较以及特定的应用案例等信息。通过阅读该论文可以更好地理解MATLAB代码的工作机制及其潜在应用场景。 总体而言,这个MATLAB工具包为研究者和工程师提供了一种在存在丢失像素条件下进行迭代相位检索的方法,这对于光学成像技术(如显微镜)、遥感及通信等领域具有重要意义。使用者可以通过调整参数并比较不同方法来优化他们的重建算法以适应不同的实际问题需求。
  • MATLAB方差分-光频谱分:用频谱域OCT像...
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    本项目提供了一套基于MATLAB的方差分析代码,专为光相干断层扫描(OCT)数据处理设计。通过该工具集可以进行有效的频谱域OCT图像重建及频谱分析,适用于科研与临床诊断应用。 MATLAB方差分析代码用于OCT(光学相干断层扫描)重建及光谱分析,以处理频域OCT图像的重建与解析工作。该代码作为我们称为MOZART的分子成像平台的一部分使用。编写此代码是为了从Thorlabs OCT系统中读取原始干涉图(推荐版本为4,但3版也适用,不过需要进行一些调整)。它能够将这些原始数据转换为OCT图像,并支持二维、三维以及散斑方差分析。 除重建图像外,该程序还具有以下功能: - 计算标准化的花斑变化以检测血管 - 实现色散补偿 - 通过双频频谱法计算频谱对立图 - 创建光谱深度校正后的图像 此外,它还能生成结合了OCT影像、光谱分析和斑点变异性的综合视图。 使用此代码及相关的数据分析可以创建如下所示的示例图片:(在连续注射两种类型的大金纳米棒后绘制小鼠耳廓的增强型OCT图像)。该应用案例参考文献为:“具有皮摩尔灵敏度的增强光学相干断层扫描,以进行功能性体内成像”,OLiba, EDSoRelle, DSen, AdeLaZerda-科学报告2016年。 我们感谢德国吕贝克Thorlabs团队在使用OCT系统及重建原始信号方面的支持。
  • MATLAB成像模拟仿真().rar
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    本资源提供了使用MATLAB进行相干衍射成像(CDI)的详细模拟和仿真的教程与代码。适合科研人员及学生学习CDI技术原理与实践操作,促进光学领域研究与发展。 资源内容:基于相干衍射成像模拟的MATLAB仿真(完整源码).rar 代码特点: - 参数化编程,便于参数更改; - 代码结构清晰,并配有详细注释。 适用对象: 该资源适用于工科生、数学专业的学生以及算法方向的学习者使用和研究。 作者介绍:一位资深的大厂算法工程师,在MATLAB、Python、C/C++及Java等语言的算法仿真领域拥有10年以上的工作经验。擅长智能优化算法、神经网络预测技术,信号处理方法,元胞自动机模型,图像处理程序设计以及多种领域的智能控制和路径规划工作,并且对无人机相关项目也有丰富的实践经验。 欢迎交流学习。
  • OSS算法_pr-of-oss.rar_过采样成像及算法
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    本资源为相干衍射与过采样相干衍射成像及其衍射算法的OSS算法代码,适用于研究光学系统中的信号处理和图像重建问题。 在相干衍射成像中,过采样平滑恢复算法是一种优化的相位恢复算法。
  • 2048Matlab-PyOCT:用光谱域光学数据处理
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    本项目提供了一个基于Python的工具PyOCT,旨在支持光谱域光学相干断层扫描(SD-OCT)的数据处理和图像重建工作,并包含2048的Matlab源码以供参考。 PyOCT 是一个用于光谱域光学相干断层扫描(SD-OCT)成像重建的工具。它的开发目的是为了进行正常的 SD-OCT 成像重建,并包含以下主要步骤: 1. 读取数据。 2. 背景扣除。 3. 频谱重采样计算。 4. 像差校正(Alpha 校正)。 5. 相机色散校正(使用相机校正系数的 Beta 校正)。 6. 逆傅立叶变换获取 OCT 图像。 该算法最初是由康奈尔大学 Steven G. Adie 教授的研究实验室在 MATLAB 中开发出来的。通过矩阵运算,重建速度得到了提升。相比 MATLAB,Python 在从二进制文件中加载数据方面表现更佳,在我们的实验室计算机上进行测试时性能更加优越。 目前 PyOCT 仅支持 Python3.0+ 版本。 要快速开始使用,请按照以下步骤操作: 1. 使用 pip 安装 PyOCT: ``` $pip install PyOCT ``` 2. 如果需要运行最新版本的代码,可以通过 git 进行安装。 成功安装后,在 Python 环境中可以测试程序: ``` $from PyOCT import VolumeReconstruction ```
  • asympPDC-master_部分及偏和偏定Matlab
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    asympPDC-master 是一个包含用于分析部分相干、相干以及偏相干和偏定向相干性的 MATLAB 代码库,适用于信号处理和物理学研究。 偏定向相干算法的MATLAB程序可以用于分析部分定向相干以及研究信号之间的因果关系。这段文字描述了如何利用特定算法进行信号处理与相关性分析。
  • PhasePack-MATLAB-MASTER_算法__成像
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    PhasePack是一款用于MATLAB环境下的相位恢复和相位成像的强大工具包。它包含多种高效的相位恢复算法,适用于科研与工程应用。 这段文字描述了相位恢复算法在计算光学成像领域中的广泛应用,这些算法主要用于解决相位恢复问题。
  • MATLAB_MATLAB_
    优质
    本代码包提供了一系列使用MATLAB进行信号处理的函数,专注于计算和分析时间序列数据中的偏相干关系。适用于科研人员及工程师探索复杂系统间的相互依赖性。 对于多输入单输出的问题,偏向于进行解耦分析以减少输入间的干扰。