
基于Matlab的熵值法代码-MSMVSampEn:一个简单的R包用于计算多元样本熵
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简介:
MSMVSampEn是一款基于Matlab开发的R包,采用熵值法,提供了一种简便的方式计算多元样本熵,适用于数据分析和复杂系统研究。
保守值法的Matlab代码MSMVSampEnR包实现了Ahmed和Mandic(2011)描述的多尺度多元样本熵测度。该实现几乎是对作者原版Matlab代码的直接翻译,尽管为提高速度与效率做了一些调整:嵌入功能用C++重写,从而显著提升了执行速度。原始方法通过计算完整距离矩阵来估计Bm(r),这在处理中等大小的数据集时容易耗尽系统内存。相比之下,本实现仅统计落在阈值r内的向量数量,完全避免了构建和使用距离矩阵。
此软件包的安装可以通过devtools::install_github(areshenk/MSMVSampEn)命令轻松完成(注意:此处不提供具体链接)。
熵可通过调用MSMVSampEn()函数来计算。例如,若要为包含白噪声的三变量时间序列求取样本熵值,则首先创建一个3xN矩阵data<-matrix(rnorm(3000),nrow=3)。接着执行如下命令:MSMVSampEn(mat=data,M,tau,eps,scaleMat=T),其中,参数M代表嵌入维数,τ为时滞参数,ε表示时间尺度,而scaleMat则控制是否应用缩放处理(默认值设为TRUE)。
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