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利用Python的机器学习算法进行小分子药物活性预测(岭回归、随机森林回归及极端森林回归结合加权平均融合模型)

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简介:
本研究采用Python编程语言,通过集成岭回归、随机森林回归和极端森林回归,并引入加权平均融合策略,有效提升了小分子药物活性的预测精度。 该项目基于机器学习算法,通过对比单模型与融合模型计算所得的指标来预测小分子在人体内的清除率。 项目运行环境包括Python、Jupyter Notebook 或 Spyder,并需要安装 matplotlib、numpy、pandas 和 sklearn 等库。 整个项目分为三个模块:数据预处理,创建并编译模型以及进行模型训练。单模型部分将分别训练岭回归模型、随机森林模型和极端森林模型。在多模型融合阶段,则采用最简单的回归问题的加权平均方法对两个表现最优的模型进行不同权重的平均,并输出最佳权重结果。 项目评估各模型性能时,以rmse(均方根误差)作为评价指标。经过分析发现,融合后的模型获得了最低的 rmse 值为2.698796237546118。

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客服
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  • Python
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    本研究采用Python编程语言,通过集成岭回归、随机森林回归和极端森林回归,并引入加权平均融合策略,有效提升了小分子药物活性的预测精度。 该项目基于机器学习算法,通过对比单模型与融合模型计算所得的指标来预测小分子在人体内的清除率。 项目运行环境包括Python、Jupyter Notebook 或 Spyder,并需要安装 matplotlib、numpy、pandas 和 sklearn 等库。 整个项目分为三个模块:数据预处理,创建并编译模型以及进行模型训练。单模型部分将分别训练岭回归模型、随机森林模型和极端森林模型。在多模型融合阶段,则采用最简单的回归问题的加权平均方法对两个表现最优的模型进行不同权重的平均,并输出最佳权重结果。 项目评估各模型性能时,以rmse(均方根误差)作为评价指标。经过分析发现,融合后的模型获得了最低的 rmse 值为2.698796237546118。
  • RF___
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    随机森林回归模型是一种集成学习方法,通过构建多个决策树并对它们的结果进行平均来预测连续值目标变量,有效减少过拟合现象。 随机森林回归建模在数据分析中的应用可以通过MATLAB的RF工具实现。这种方法能够有效提升预测准确性,并且适用于处理大量特征的数据集。使用随机森林进行回归分析可以更好地捕捉数据间的复杂关系,同时减少过拟合的风险。
  • 卡路里消耗:运线、XGBoost、Lasso
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    本文探讨了使用多种机器学习方法(包括线性回归、岭回归、XGBoost回归、Lasso回归和随机森林回归)来预测卡路里消耗,旨在寻找最准确的模型以帮助健康管理。 机器学习在预测卡路里消耗方面可以采用多种方法: 1. 线性回归:这是一种基本的统计模型,用于描述连续变量与一个或多个自变量之间的线性关系。在预测卡路里消耗时,它可以用来建立运动时间、体重等其他相关因素和卡路里的线性关联。 2. 岭回归:作为一种处理多重共线性的方法,岭回归通过向损失函数添加正则化项来减少参数的方差,并防止模型过拟合。在预测卡路里消耗时,它有助于提高模型对新数据点的预测准确性。 3. XGBoost 回归:这是一种先进的机器学习技术,基于梯度提升树算法构建集成系统。通过迭代训练多个决策树并结合这些树木来形成一个更加强大的单一模型,在非线性关系中尤其有效。在卡路里消耗预测问题上,XGBoost 可以帮助捕捉复杂的数据模式。 4. Lasso 回归:Lasso(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator)回归使用L1正则化来选择特征并压缩参数向量中的某些系数为零。这使得模型更加简洁、易于解释,并且有助于避免过度拟合问题,从而在预测卡路里消耗时提高准确性。 5. 随机森林:随机森林是另一种集成学习方法,通过组合大量决策树的输出来生成最终结果。这种方法可以有效处理高维度数据集中的噪声和不相关特征,在预测卡路里的场景中能够提供强大的泛化能力。
  • 建立
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    简介:本项目聚焦于通过Python编程语言构建随机森林回归模型,旨在利用集成学习方法提高预测准确性,适用于处理具有大量特征的数据集。 主要使用sklearn中的随机森林回归模型来对波士顿房价进行预测。
  • 基于MATLAB数据(RF
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    本研究运用随机森林算法在MATLAB平台上实现数据回归预测。通过构建RF回归模型,有效提升了预测精度和鲁棒性,适用于复杂数据分析与建模任务。 1. 视频链接:https://www.bilibili.com/video/BV1uW4y1h7vM/?vd_source=cf212b6ac033705686666be12f69c448 2. 使用Matlab实现随机森林算法的数据回归预测,包含完整源码和数据。 3. 实现多变量输入、单变量输出的回归预测。 4. 评价指标包括:R²、MAE(平均绝对误差)、MSE(均方误差)以及RMSE(根均方误差)。 5. 包含拟合效果图及散点图展示。 6. 数据使用Excel格式,推荐2018B及以上版本。
  • 基于RF
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    本研究构建了一种基于RF(随机森林)算法的回归预测模型,有效提高了数据预测的准确性和稳定性。通过优化参数和特征选择,该模型在多种数据集上展现出色性能,为复杂系统分析提供了有力工具。 基于RF随机森林机器学习算法的回归预测模型。
  • CPU占有率
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    本研究提出了一种基于随机森林回归模型的机器学习算法,用于准确预测系统中CPU占用率,旨在优化资源管理和提高性能。 这段代码使用Pandas、scikit-learn和tqdm库通过随机森林回归模型来预测虚拟机的行为。它首先从CSV文件读取训练数据,并对虚拟机ID进行独热编码,接着利用时间和编码后的特征训练模型,在进度条的显示下完成这一过程。然后,代码会从另一个CSV文件中读取测试数据并对这些数据执行相同的编码处理步骤。使用之前构建好的模型预测出虚拟机的行为(即平均值),并将结果逐行输出。最后一步是创建一个DataFrame,并生成一个新的CSV文件来保存预测的结果。整个程序的目的是为了分析虚拟机的行为并提供可用于进一步研究的数据。
  • _Matlab_工具箱_
    优质
    本资源提供随机森林算法在MATLAB中的实现,涵盖分类与回归应用。包含详细的随机森林工具箱及教程文档,助力用户深入理解与使用随机森林模型。 随机森林MATLAB工具箱可以用于分类和回归任务。
  • RF_Regressor: 基于sklearn
    优质
    RF_Regressor是一款基于sklearn库开发的高效随机森林回归预测工具,适用于多种数据集,能够提供准确的数值预测结果。 使用sklearn的随机森林回归器(RF_regressor)构建预测模型。