ModelSEED数据库：此仓库包含了利用ModelSEEDProbAnno方法建立模型所需的生物化学及元数据的最终版本

简介：
ModelSEED数据库汇集了通过ModelSEEDProbAnno方法构建代谢模型所需的所有生物化学和元数据的权威版本，是开展系统生物学研究的重要资源。 多年来，ModelSEED一直是构建基于带注释的微生物或植物基因组的基因组规模代谢模型草案的主要资源。其生物化学数据库是支撑ModelSEED和KBase的核心数据基础。该数据库具有以下特性：（i）涵盖区室化、转运反应、电荷分子以及质子对反应平衡；（ii）由用户社区扩展，所有数据存储在GitHub上；（iii）作为生化的“罗塞塔石”，用于比较并整合来自多种工具和数据库的注释。该生物化学数据库是通过汇集不同资源中的化学信息，并应用标准转换、识别冗余以及计算热力学性质等步骤构建而成。利用通量平衡分析，对ModelSEED的生物化学数据进行持续测试，以确保其可用于建模并能够模拟各种表型。此外，本体设计旨在帮助比较和协调代谢重构工作。