
临床试验结果预测分析:基于临床试验数据
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简介:
本研究聚焦于通过先进的统计与机器学习方法,对临床试验数据进行深度挖掘和模式识别,以实现对未来临床试验结果的精准预测。致力于提升药物研发效率及成功率。
临床试验结果预测
1. 通过Conda安装
使用conda.yml文件创建并激活环境:
```
conda env create -f conda.yml
conda activate predict_drug_clinical_trial
```
2. 原始数据
原始数据存储在`.ClinicalTrialGov`目录中,包含超过348,891条临床试验记录。由于不断新增的临床试验信息,数据量会持续增长。
3. 数据预处理
3.1 收集所有NCTID
从`.ClinicalTrialGov`目录下收集所有的XML文件,并将结果存放在`data/all_xml`中:
```
find ClinicalTrialGov -name NCT*.xml | sort > data/all_xml
```
3.2 疾病分类到ICD-10编码
此步骤涉及将疾病名称映射为ICD-10编码,输入数据包括ClinicalTrialGov目录下的文件和`data`中的重写内容。
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