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MATLAB开发:Siemens Dicom Sort与Convert to Nifti

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简介:
本项目利用MATLAB开发了两个工具:Siemens Dicom Sort用于整理西门子DICOM格式医学影像数据;Convert to Nifti则负责将这些数据转换为NIfTI标准格式,便于进一步的医疗图像处理和分析。 在MATLAB开发环境中实现Siemens dicom sort和Convert to nifti功能,可以将西门子MRI的DICOM数据转换为NIFTI格式,并且能够匿名并排序到扫描目录中。

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  • MATLABSiemens Dicom SortConvert to Nifti
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    本项目利用MATLAB开发了两个工具:Siemens Dicom Sort用于整理西门子DICOM格式医学影像数据;Convert to Nifti则负责将这些数据转换为NIfTI标准格式,便于进一步的医疗图像处理和分析。 在MATLAB开发环境中实现Siemens dicom sort和Convert to nifti功能,可以将西门子MRI的DICOM数据转换为NIFTI格式,并且能够匿名并排序到扫描目录中。
  • dcm2niix: DICOMNIfTI的转换工具
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    DCM2NIIX是一款高效便捷的软件工具,专门用于将医学影像文件格式DICOM转换为NIfTI格式,便于神经影像学数据处理与分析。 dcm2niix 是一款用于将神经影像数据从 DICOM 格式转换为 NIfTI 格式的工具。该软件的最新稳定版本可以在多个操作系统(包括 Linux、MacOS 和 Windows)上编译并提供下载。完整的用户手册也一同发布。 这款开源软件主要遵循 BSD 许可证,部分代码则属于公共领域或采用 MIT 许可证授权(例如 nifti*.*, miniz.c, ujpeg.cpp)。具体详情请参阅 license.txt 文件。 dcm2niix 通常可以在 macOS、Linux 和 Windows 系统上直接运行而无需额外安装其他软件。然而,如果用户希望使用该工具创建 GZ 压缩图像,则建议先安装 pigz 软件以获得更佳的压缩性能和速度。可以通过官方渠道获取针对不同操作系统的 dcm2niix 及其配套的 pigz 版本。 此外,DICOM 格式提供了多种存储及压缩医学影像数据的方法。dcm2niix 支持启用不同的选项来兼容更多种类的数据格式,并能高效地进行图像转换与压缩处理。
  • 西门子 DICOM 转换及排序至 NIfTI:将西门子 MRI 的 DICOM 数据转成 NIfTI 格式,并进行匿名处理排序...
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    本工具用于转换并整理医学影像数据,专门针对西门子MRI设备生成的DICOM文件,将其高效地转化为NIfTI格式,同时确保患者信息的安全性。 该程序提供了GUI(dicom_sort_convert_main.m)和命令行输入(example_dscm_call.m),用于选择输入和输出目录并设置选项。主要功能包括:i) 将西门子MR扫描仪(IMA)数据分类到不同的文件夹中,删除患者姓名,并进行轻微的匿名处理(仅对PatientName字段进行处理,但不涉及出生日期、性别或PatientID等信息);ii) 转换为单个NIfTI格式(.nii)或两个文件(NIfTI .img和.hdr),每次扫描一个。对于复杂的扫描,程序会重新组织数据以适应最多六个维度的NIfTI结构(时间点、回波、RF通道、相位/幅度等)。此外,还会将DICOM头信息以及西门子特有的头部信息写入到text_header.txt文件中;iii) 列出所有执行过的扫描(在scan_list.txt文件中),包括最相关的参数,并且这些输出可以根据需要进行自定义。
  • 利用SimpleITK进行NIfTI/DICOM文件的读取保存示例
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    本示例教程展示了如何使用Python库SimpleITK来读取和保存医学影像格式如NIfTI和DICOM的文件,帮助开发者快速掌握相关技术。 本段落主要介绍了使用SimpleITK读取和保存NIfTI/DICOM文件的实例,具有很好的参考价值,希望能对大家有所帮助。一起跟随文章内容深入了解吧。
  • DICOM 3.5.4
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    DICOM 3.5.4开发包是一款遵循DICOM标准的软件工具集,旨在简化医学影像数据的处理与交换,适用于医疗设备制造商及医疗机构。 DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是一种标准,用于在医疗环境中交换医学图像和其他相关数据。DCMTK(DICOM Toolkit)是实现这一标准的开源工具包,并主要使用C++编程语言开发。在这个dicom3.5.4开发包中,包含的是DCMTK的3.5.4版本,它提供了各种库、实用程序和示例代码,帮助开发者处理DICOM数据。 DCMTK的主要组成部分包括: 1. **dcmdata**:这是核心库,负责处理DICOM的数据元素和字典。它包含了解析和创建DICOM数据元素的功能,以及处理DICOM文件的基本结构。 2. **dcmimgle**:这个库专注于图像数据的处理,可以将DICOM图像数据转换为常见的图像格式,如JPEG、PNG等,反之亦然。 3. **dcmjpeg**:专门处理JPEG编码的DICOM图像,支持基本和进程JPEG编码。 4. **dcmnet**:处理DICOM网络通信协议,如TCPIP连接,支持DICOM通信服务类(DIMSE)和DICOM传输控制协议(DUL)。 5. **dcmimage**:更高级的图像处理库,提供图像操作如调整对比度、亮度等。 6. **dcmfg**:处理DICOM文件集(FIL)和文件集合元数据(FG)。 7. **dcmsr**:用于处理DICOM的结构化报告(SR),可以读取、创建和修改SR文档。 8. **dcmsign**:提供 DICOM 安全性功能,如数字签名和完整性校验。 9. **apps**:包含了一系列命令行实用程序,如dcmdump用于打印DICOM文件的内容,dcmj2pnm用于JPEG到非DICOM图像的转换等。 10. **examples**:提供示例代码,帮助开发者理解如何使用DCMTK来实现特定功能。 开发 DICOM 应用程序时,DCMTK 提供了以下关键功能: - **DICOM 文件读写**:使用 DCMTK 可以轻松地读取或创建符合 DICOM 标准的文件。 - **网络通信**:通过 dcmnet 模块可以建立与 DICOM 设备的连接,并进行数据传输和交互。 - **图像处理**:dcmimgle 和 dcmimage 库提供了图像转换及处理工具。 - **数据解析**:dcmdata 模块帮助解析DICOM 数据元素和字典,理解DICOM 文件结构。 - **结构化报告**:dcmsr库允许创建、读取并修改复杂的结构化报告,提高医疗信息的可读性和分析性。 - **安全与认证**:dcmsign 库支持对 DICOM 数据进行签名及验证,确保数据完整性和安全性。 在开发过程中,开发者需要遵循DICOM标准,并理解每个数据元素的意义及其在网络通信中的作用。同时需熟悉DCMTK提供的API和示例代码以便高效集成到自己的应用程序中。 dicom3.5.4 开发包为医疗图像与数据的开发提供了强大工具,涵盖了从数据解析、图像处理至网络通信等各个方面,在医疗信息化领域不可或缺。通过深入学习利用 DCMTK ,开发者可以构建符合DICOM标准的高质量医疗应用。
  • DICOMNIFTI的医学图像格式转换工具
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    这款DICOM转NIFTI的医学图像格式转换工具旨在为医疗专业人士提供高效、便捷的服务。它能够快速准确地将DICOM格式的医学影像数据转换成NIFTI格式,便于进行进一步的数据分析和处理,大大提高了临床科研的工作效率。 医学图像格式转化软件(DICOM转NIfTI)可以方便地将不同格式的医学影像数据进行转换,以便于研究或临床应用中的进一步处理与分析。这类工具通常支持批量操作,并且能够保持原始图像的数据完整性及元信息准确无误地传递到目标文件中。
  • Delphi中的DICOM
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    《Delphi中的DICOM开发》是一本专注于使用Delphi编程语言进行医学影像处理的指南,详细介绍如何在医疗软件中实现和应用DICOM标准。 DICOM Delphi 例程 这段文字主要提到关于使用Delphi语言编写处理医学影像数据标准(DICOM)的相关示例程序或代码片段。如果需要更详细的解释或者具体的例子,可以进一步询问相关技术细节或是查找专门的教程和文档来获取更多信息。
  • DICOM 源代码
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    《DICOM源代码开发》是一本专注于医学成像标准DICOM协议编程实现的技术书籍,详细指导开发者如何进行DICOM应用的源码编写与调试。 DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是一种国际标准,在医疗环境中用于交换、存储及打印医学影像及其相关临床数据。该标准定义了数据结构、通信协议与文件格式,确保不同设备间的互操作性。 DICOM库是实现这些功能的核心组件,提供处理和解析DICOM数据的工具。在DICOM3.0开发库中,我们可以期待找到用于开发DICOM应用程序的基础架构及实例代码。此库可能包括以下关键组件: 1. **数据解析器**:解析包含病人信息、影像序列与图像像素等元素的字节流,并将其转换为易于处理的对象。 2. **网络通信模块**:实现DICOM的网络传输协议,支持应用发送和接收DICOM对象及执行如C-FIND、C-MOVE、C-GET等服务类操作。 3. **存储和检索服务**:允许应用程序将医学影像存入或从PACS系统中检索出来。 4. **元数据处理**:管理设备信息、时间戳与病患ID等关键数据,这些对于医疗诊断及研究至关重要。 5. **图像处理功能**:提供基本的如缩放、旋转和灰度调整以及更高级的功能,例如重采样和影像融合等功能。 6. **示例应用代码**:帮助开发者通过简单DICOM 数据查看器、传输客户端与服务器等实例了解如何使用库进行开发。 7. **API文档**:为用户提供详细的接口说明,以便快速掌握库的用法。 在ksDicomKitLite子文件夹中可能包含此DICOM开发库的核心功能版本,适合资源有限或需要快速集成应用的项目。通过利用这样的库,开发者可以构建如PACS服务器和客户端、影像查看器及数据迁移工具等多样的医疗影像应用程序,并结合医学图像生成电子病历。 理解DICOM标准及其通信协议与熟悉基本原理和技术是开发高效准确的应用的基础。