popgen-stats：一个脚本，用于计算种群遗传学统计数据，提供源码。

简介：
该脚本，名为 selectionStats.py，主要用于计算种群遗传学统计数据的流行统计方法。其设计目标是快速地对齐序列，从而高效地获得分集和选择统计信息。比对过程需要在帧编码序列中进行明确的表示。 selectionStats.py 能够计算出theta、pi、piN、piS以及Tajima的D等关键指标。此外，如果提供了外联组数据，该脚本还会输出McDonald Kreitman测试的结果。用户可以通过提供单个Fasta文件进行比对，或者提供包含多个Fasta文件的目录进行批量比对。 该程序对Bio ++有要求，具体需要EggLib（ ）的当前版本，以及Bio ++ v 2.1.0。 同时，selectionStats.py 的运行环境为 Python v 2.7.3，EggLib v 2.1.7。 关于绘图方面，selectionStatsPlot.R 脚本用于绘制 selectionStats.py 的结果，它依赖于 ggplot2 包。 该 R 脚本的当前版本为 R v 3.0.2，ggplot2 v 0.9 。