QSIPrep：扩散MRI的预处理与重建-源码

简介：
QSIPrep是一款专门用于扩散加权磁共振成像（DWI）数据的预处理和重建工具。该软件包提供了高质量的数据准备流程，以支持后续分析，并开源了其源代码以便于科研人员学习和改进。 QSIprep：q空间图像的预处理与分析 该文档详细介绍了qsiprep软件配置用于扩散加权MRI（dMRI）数据处理管道的方法。其主要功能是利用BIDS-app方法对几乎所有现代扩散MRI数据类型进行预处理。 通过自动生成的预处理流程，可以正确地分组扫描、校正畸变和运动，并执行降噪、共配准及重新采样操作，最终生成可视报告与质量控制指标。该系统支持运行包括但不限于特定算法在内的先进重构管道。此外，还为DSI（扩散谱成像）及其随机q空间采样的方案提供了新的运动校正算法。 预处理工作流根据输入的BIDS格式数据自动生成，并确保对场图进行正确的处理。具体步骤涵盖了头部运动校正、磁化率失真校正、MP-PCA降噪以及T1加权图像与标准空间模板之间的配准操作，同时也包括组织分割等任务。 最后，通过qsiprep提供的精选重构工作流（如ODF重建），可在多种其他软件包中进一步应用其输出结果。