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转录组测序的分析流程

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简介：
转录组测序的分析流程涉及从原始数据处理到基因表达量计算、差异表达分析等一系列步骤，旨在全面解析生物体在特定条件下的转录状态。 转录组测序分析流程主要包括数据预处理、基因表达量计算、差异表达基因筛选以及功能富集分析等步骤。首先对原始序列进行质量控制并去除低质量读段，然后使用比对工具将过滤后的reads映射到参考基因组上；其次根据比对结果统计每个转录本或基因的表达水平；接着通过比较不同实验条件下的样本数据来鉴定差异表达的基因；最后利用生物信息学软件进行GO注释和KEGG通路分析，揭示这些DEGs可能参与的生物学过程及信号传导途径。

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  • 转录组测序的分析流程
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    转录组测序的分析流程涉及从原始数据处理到基因表达量计算、差异表达分析等一系列步骤，旨在全面解析生物体在特定条件下的转录状态。 转录组测序分析流程主要包括数据预处理、基因表达量计算、差异表达基因筛选以及功能富集分析等步骤。首先对原始序列进行质量控制并去除低质量读段，然后使用比对工具将过滤后的reads映射到参考基因组上；其次根据比对结果统计每个转录本或基因的表达水平；接着通过比较不同实验条件下的样本数据来鉴定差异表达的基因；最后利用生物信息学软件进行GO注释和KEGG通路分析，揭示这些DEGs可能参与的生物学过程及信号传导途径。
     
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  • RNA-seq分析流程：利用STAR、RSEM、HISAT2或Salmon进行转录组测序，并包含同工型计数及全面质量控制
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  • MAESTRO：单细胞转录组与规则组分析工具管道
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  • 坐标测量转换程序及实例分析
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