
利用隐马尔可夫模型进行蛋白质序列筛选的算法
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简介:
本研究提出了一种基于隐马尔可夫模型(HMM)的算法,用于高效地从大量数据中筛选出具有特定特征的蛋白质序列。
本段落研究了一种蛋白质序列筛选算法,并针对数据库中存在的大量冗余序列问题提出了基于隐马尔可夫模型的解决方案。详细介绍了在蛋白质数据库中如何构建隐马尔可夫模型,以及对模型主要参数进行求解与估计的具体计算公式。通过利用所建立的模型进行了蛋白质数据库中的序列筛选测试,结果显示该算法能够以95%以上的精度识别同源蛋白质序列。
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