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TCGA临床数据的提取

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简介：
本研究聚焦于从TCGA数据库中高效、准确地提取临床相关信息，旨在为癌症研究和治疗提供有力的数据支持。 自己编写程序来整理和提取TCGA的临床信息，以便进行生存分析。

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  • TCGA临床数据的提取
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    本研究聚焦于从TCGA数据库中高效、准确地提取临床相关信息，旨在为癌症研究和治疗提供有力的数据支持。 自己编写程序来整理和提取TCGA的临床信息，以便进行生存分析。
     
  • 结直肠癌TCGA和GEO数据库的临床数据
    优质
    本研究综合分析了来自TCGA和GEO数据库的大量结直肠癌患者临床数据，旨在探索其分子特征与临床信息之间的关联。 实时更新TCGA和GEO数据库中的结直肠癌临床资料。
     
  • TCGA-STAD-mRNA表达数据——胃癌临床与表达数据集整理
    优质
    本数据集整合了TCGA数据库中的胃癌患者mRNA表达数据及相应的临床信息，旨在为研究者提供全面的数据支持。 TCGA-STAD数据集已经转换为LCPM格式，并且临床数据已汇总整理完毕。LCPM格式是指log2(CPM+1)格式，现在认为使用log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)的分析方法较为过时。部分生物信息学文章的审稿人推荐采用这种新的格式进行数据分析。
     
  • TCGA-BRCA-mRNA表达数据——乳腺癌临床与表达数据整理
    优质
    本研究整合并分析了来自TCGA数据库的乳腺癌（BRCA）mRNA表达谱及其相关临床信息，旨在探索基因表达与患者预后之间的关联。 TCGA-BRCA数据集已整理为LCPM格式，并且临床数据也已完成汇总整理。LCPM格式即log2(CPM+1)格式，现认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式较为过时。部分生信文章的审稿人推荐使用此格式进行数据分析。
     
  • 甲状腺癌TCGA-THCA-mRNA表达与临床数据集整理
    优质
    本研究收集并分析了TCGA数据库中的甲状腺癌（TCGA-THCA）患者的mRNA表达谱及其相关临床信息，旨在探索基因表达模式与患者预后之间的关联。 需要将数据转换为log2(TPM+1)形式才能进行后续分析。
     
  • 食管癌mRNA表达与临床数据集整理（基于TCGA-ESCA）
    优质
    本研究旨在通过分析TCGA数据库中的食管癌(ESCA)样本mRNA表达谱，结合患者的临床信息，系统地整理和挖掘相关数据，以期发现新的生物标志物及治疗靶点。 TCGA-ESCA数据集已整理为LCPM格式，并且临床数据也已完成汇总整理。LCPM即log2(CPM+1)格式，在当前研究中被认为比log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)更合适。部分生信文章的审稿人推荐使用此格式进行数据分析。
     
  • TCGA-READ-mRNA表达数据——直肠癌临床与表达数据分析整合
    优质
    本研究基于TCGA数据库，深入分析了直肠癌患者mRNA表达谱，并结合临床信息进行综合评估，旨在揭示基因表达与疾病预后的关系。 TCGA-READ数据集已整理为LCPM格式，并且临床数据已经汇总完成。LCPM格式是指log2(CPM+1)格式，现在认为使用log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)这两种格式较为过时了。部分生物信息学文章的审稿人建议采用这种新的格式进行数据分析。
     
  • TCGA-COAD-mRNA表达数据——结肠癌临床与表达数据分析整合
    优质
    本研究基于TCGA数据库，深入分析了结肠癌患者的mRNA表达谱，并结合其临床特征，探索基因表达与疾病进展的关系。 TCGA-COAD数据集已整理成LCPM格式，并且临床数据也已完成汇总与整理。LCPM格式是指log2(CPM+1)格式，目前认为该格式比log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)更为先进。部分生信文章的审稿人推荐使用此格式进行数据分析。
     
  • 卵巢癌mRNA表达数据及临床信息整理（基于TCGA-OV数据）
    优质
    本研究基于TCGA-OV数据库，对卵巢癌患者的mRNA表达数据和临床资料进行系统整理与分析，旨在揭示潜在的生物标志物和治疗靶点。 TCGA-OV数据集已整理成LCPM格式，并且临床数据已经汇总完毕。LCPM格式指的是log2(CPM+1)格式，而根据当前的行业标准，log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式被认为较为过时。部分生信文章审稿人推荐使用这种新的格式进行数据分析。