
Infercnvpy:利用scRNA-seq数据推断拷贝数变异(CNV),无缝集成于Scanpy生态系统中
5星
- 浏览量: 0
- 大小:None
- 文件类型:None
简介:
Infercnvpy是一款专为单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据设计的Python工具,能够高效地识别和推断拷贝数变异(CNV),并完美兼容Scanpy分析框架,助力深入解析基因组结构变异。
Infercnvpy 是 Scanpy 的一个插件,用于从单细胞转录组学数据推断拷贝数变异(CNV)。Infercnv 是一个可扩展的 Python 库,能够从这类数据中推测出 CNV 事件。它基于 InferCNV 设计,但进行了优化和改进以提高其伸缩性。
请注意:此软件包尚处于试验阶段,结果未经验证,并且虽然看起来与 InferCNV 的结果相似,但仍存在差异。
我们非常欢迎您的反馈和支持!
安装要求:
- Python 3.8 或更高版本
您可以选择以下方式来安装 infercnvpy:
1. 安装最新稳定版:使用 pip install infercnvpy 命令。
2. 获取最新的开发版:通过 pip install git+https://github.com/icbi-lab/infercnvpy.git 命令。
全部评论 (0)
还没有任何评论哟~


