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基于MATLAB的脑电相位滞后指数代码—用于昏迷预后的EEG分析: ComaPrognosticUsingEEG

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简介:
本项目提供了一套基于MATLAB开发的脑电相位滞后指数(PLI)计算工具,专门用于分析昏迷患者的脑电图数据,以预测其恢复前景。代码旨在辅助医疗研究人员进行深入的EEG数据分析与研究工作。 该存储库包含用于生成量化EEG波形复杂性、类别及连通性的代码,所有代码均使用MATLAB 2016a编写。“ALL_FEATURES_ONE_CH_V2.m”文件中包含了计算复杂性和类别的特征提取代码,“ALL_FEATURES_TWO_CH_V2.m”则提供了连接功能的生成代码。 我们的EEG复杂度特征包括:Shannon熵、Tsalis熵(q值范围为1至10)、倒谱系数、子带信息量、Lyaponov指数、分形维数、Hjorth迁移率和复杂性,假最近邻嵌入维度及二次自回归模型的参数。 连通性的特征包括:一致性三角阵,所有频段的一致性度量,相位滞后指数(PLI),互相关系数及其延迟值,互信息以及格兰杰因果关系。此外,类别相关的特征还包括标准偏差、信号规律性、EEG各频带功率(δ, θ, α, β, γ, μ)、α/δ比率、小于5微伏的信号幅度比例、小于10微伏和20微伏的振幅比例、“正常”脑电图,弥散减慢现象以及癫痫样尖峰数量及后续三角阵功率变化。 我们还利用以下特征来量化突发抑制:爆发持续时间(平均值与标准差)及其间歇期长度(均值)。

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  • MATLABEEG: ComaPrognosticUsingEEG
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    本项目提供了一套基于MATLAB开发的脑电相位滞后指数(PLI)计算工具,专门用于分析昏迷患者的脑电图数据,以预测其恢复前景。代码旨在辅助医疗研究人员进行深入的EEG数据分析与研究工作。 该存储库包含用于生成量化EEG波形复杂性、类别及连通性的代码,所有代码均使用MATLAB 2016a编写。“ALL_FEATURES_ONE_CH_V2.m”文件中包含了计算复杂性和类别的特征提取代码,“ALL_FEATURES_TWO_CH_V2.m”则提供了连接功能的生成代码。 我们的EEG复杂度特征包括:Shannon熵、Tsalis熵(q值范围为1至10)、倒谱系数、子带信息量、Lyaponov指数、分形维数、Hjorth迁移率和复杂性,假最近邻嵌入维度及二次自回归模型的参数。 连通性的特征包括:一致性三角阵,所有频段的一致性度量,相位滞后指数(PLI),互相关系数及其延迟值,互信息以及格兰杰因果关系。此外,类别相关的特征还包括标准偏差、信号规律性、EEG各频带功率(δ, θ, α, β, γ, μ)、α/δ比率、小于5微伏的信号幅度比例、小于10微伏和20微伏的振幅比例、“正常”脑电图,弥散减慢现象以及癫痫样尖峰数量及后续三角阵功率变化。 我们还利用以下特征来量化突发抑制:爆发持续时间(平均值与标准差)及其间歇期长度(均值)。
  • MATLAB FieldTrip计算及静息态
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    本代码利用MATLAB FieldTrip工具箱进行脑电数据处理,实现相位滞后指数(PLI)计算,并提供静息态数据的全面分析方法。适合神经科学和信号处理研究者使用。 欢迎使用ARCEEG静止状态Wiki!该维基的主要目的是为用户提供关于如何利用GitHub上提供的脚本进行操作的最低限度指导。这些脚本主要用于分析在BioSemi ActiveTwo系统(采用64通道记录,并以外部电极6作为参考电极,即放置于乳突上的位置)所采集到的静止状态EEG数据。 我们的假设是,触发代码已经应用于闭眼和睁眼的状态段落中,而我们目前仅关注闭眼阶段的数据。当前预处理步骤包括:读取试验及相应触发码,并且只选择闭眼的部分进行分析。基本的预处理措施有衰减、去趋势化、使用60Hz以下低通滤波器以及重新参考乳突电极;可能还会采用50Hz带通滤波以去除线噪声,同时将采样率调整至256Hz。 在完成这些步骤之后,可以进行可选的检查来识别并重建噪音通道(仅当该通道的质量极其差时才考虑此操作)。然后利用独立成分分析法分解数据,并通过目视检验确认所得分量。接下来是分割连续记录为4秒片段的操作,以便后续用于WPLI(加权相位滞后指数)的计算。 随后我们会重置实验时间戳以支持实地考察中将其视为单独“试验”。针对每个频带使用多锥度快速傅立叶变换分别计算出加权相位滞后指数。基于此进一步从WPLI邻接矩阵衍生各种图形指标,并且最后会评估额叶不对称性和半球内前后平衡。 步骤1至5中的操作非常重要,其中部分需要手动完成(例如检查试)。
  • MATLAB续行-EEG-ISC:计算图间个体关性MATLAB
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    这段简介可以描述为:MATLAB Code Continuation-EEG-ISC 是一个专为研究者设计的MATLAB工具包,用于计算不同被试间脑电活动的相关性,促进对大脑网络连接的理解。 这是一个Matlab工具包,用于计算EEG数据中的对象间相关性(ISC)。 它还包含用于批量处理BrainVision(BV)文件的实用程序功能。 此项目建立在先前的工作基础上。 专长: 包括批处理BrainVision(BV)文件的实用程序:加载、对齐到相同的起点终点; 内部中间结果缓存,这样可以继续之前停止的操作; 针对多个处理器优化代码(parfor); 使用引导方法计算数据的重要性。 请参阅文档以获取已记录的示例运行。 根据GUN通用公共许可证免费提供EEG-ISC。如果使用,请引用相关出版物。
  • MatlabEDF
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    这段简介可以这样写: 本代码集旨在为使用MATLAB进行EDF格式脑电数据的预处理和分析提供便利,涵盖信号读取、滤波及特征提取等功能。 Matlab EDF脑电分析代码用于读取EDF格式的脑电数据,并进行数据分析。
  • Verilog超前字锁
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    本项目设计并实现了一种基于Verilog的超前滞后型数字锁相环(DLL),用于精确频率和相位同步。通过先进的时钟管理和延迟控制技术,确保了高速信号处理中的稳定性和精度。 超前滞后型数字锁相环(Digital Phase-Locked Loop,DPLL)在通信、信号处理及时钟同步等领域有着广泛的应用。本项目主要关注其构成组件及其Verilog实现方法。 该类型的锁相环包括三个核心组件:数字鉴相器(Digital Phase Detector, PD)、数字滤波器(Digital Filter, DF)和数字压控振荡器(Digital Voltage-Controlled Oscillator, DVCO)。这些组件协同工作,以确保精确跟踪输入时钟信号。 1. **数字鉴相器**作为锁相环的第一步,其功能是检测输入参考时钟与DVCO输出时钟之间的相位差。超前滞后型的鉴相器通常有两个比较器来判断输入和输出时钟之间相对的相位关系:当输出时钟领先于输入信号,则产生高电平;如果落后则生成低电平,两者同步时不明确。 2. **数字滤波器**接收来自鉴相器的数据,并通过过滤过程生成控制电压。该电压会根据相位误差进行调整以减少这种偏差。可以使用不同阶数的滤波器来提供适当的环路带宽和稳定性,在Verilog中可通过定义相应的系数和结构实现。 3. **数字压控振荡器**则依据来自滤波器的控制信号改变其自身频率输出,本例中的DVCO时钟是输入时钟的六倍频。设计过程中需保证该组件能够快速且稳定地响应输入变化并调整自身的频率特性。 在Verilog中实现这些元件需要掌握基本语法和逻辑操作知识:鉴相器通常用组合逻辑来完成;滤波过程一般通过连续赋值及寄存器结构来达成,而DVCO则利用控制电压调节内部计数器的速度以改变输出频率。设计时应注重模块化原则,将各组件封装为独立可复用的模块。 在DPLL.v文件中会包含这些元件的具体Verilog代码实现。通过分析和理解这部分内容不仅可以深入学习锁相环的工作原理,还能提升Verilog编程技巧,并且对FPGA应用开发具有积极意义。最终还需进行仿真与综合测试以验证设计是否符合预期的功能需求以及性能指标。 超前滞后型数字锁相环是一个复杂的系统,其设计实现需要各个组件间的良好协作理解每个部分的作用和在Verilog中的具体实现方式对于学习数字系统设计及FPGA开发非常关键。通过实际项目的操作实践,可以更好地结合理论知识与实际技能。
  • Matlab-超前校正器
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    本项目基于MATLAB开发了一种有效的滞后-超前校正器设计方法,通过优化控制系统性能,实现快速响应与稳定性兼顾的目标。 基于滞后—超前的校正器,在MATLAB环境中对一个函数对象进行滞后-超前校正。使用的是纯MATLAB代码编写,并未采用Simulink工具箱。通过设计合适的校正器,使系统在单位斜坡输入下的稳态误差、开环截止频率以及相角裕度达到特定的设计要求。项目包含多个.m文件和详细的设计说明报告,并提供参考文献以供追踪溯源。整个方案可以直接进行仿真使用。
  • leadlagcorr.zip_时间序列_matlab_超前关性研究
    优质
    本资源提供了一个用于探究时间序列中超前与滞后关系的MATLAB工具包,包含多种函数以实现对信号间延迟和同步性的深入分析。 用于进行两个时间序列的超前滞后相关分析的MATLAB语言代码。
  • MATLAB导入Excel-EEG处理: 据准备
    优质
    本教程介绍如何使用MATLAB读取和处理来自Excel文件的脑电(EEG)数据,涵盖数据导入、基本清洗及预处理步骤,为后续分析奠定基础。 在MATLAB环境中处理脑电图(EEG)数据通常需要一些预处理步骤。这些任务可以通过使用Matlab的EEGLAB工具箱或FieldTrip工具箱中的函数来实现,而专门为此目的编写的MATLAB函数则可以简化这一过程。 为了有效地进行这项工作,请确保您已经安装了以下软件和插件: - EEGLAB - FieldTrip(建议包含SASICA插件) - 可选:Cleanline, erplab 和erptools 特别注意,如果在64位Linux系统上使用“binica”,需要执行如下命令以解决兼容性问题: ``` sudo apt-get install lib32z1 ``` 此外,您还需要一个配置(cfg)文件来指定所有可变参数的设置。这包括数据文件的位置、采样率以及滤波器的具体设定等。 最后,准备一个名为“SubjectsTable.xlsx”的Excel表格以包含您的参与者列表及相关信息。此表中特别重要的列有: - “名称”:每个数据集的独特标识符(如代码或别名) - 可选:“replace_chans”:用于记录因电极损坏而替换的信息 以上步骤和文件的准备将帮助您顺利地在MATLAB环境中对EEG数据进行预处理。
  • EEGLab:EEG处理Matlab工具包
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    EEGLab是一款基于MATLAB开发的开源软件工具包,专门用于脑电(EEG)数据的采集、预处理和分析。它提供了一系列用户友好的界面和先进的算法,帮助研究人员高效地探索大脑活动模式。 基于MATLAB的EEG脑电处理工具包EEGLAB能够方便地进行脑电数据处理。
  • SVM类器DEAP据情感Matlab
    优质
    本项目采用支持向量机(SVM)分类算法,在MATLAB平台上对DEAP数据库中的脑电数据进行情感识别与分析,旨在探索情感计算的新方法。 版本:MATLAB 2019a 领域:基础教程 内容:基于时频域特征分析与SVM分类器的DEAP脑电信号情感状态识别(四分类),附带MATLAB代码 适合人群:本科、硕士等教研学习使用